Protein–RNA interactions for Protein: Q80VQ0

Aldh3b1, Aldehyde dehydrogenase family 3 member B1, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aldh3b1Q80VQ0 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Aldh3b1Q80VQ0 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Aldh3b1Q80VQ0 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Aldh3b1Q80VQ0 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Aldh3b1Q80VQ0 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Aldh3b1Q80VQ0 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Aldh3b1Q80VQ0 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Aldh3b1Q80VQ0 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Aldh3b1Q80VQ0 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Aldh3b1Q80VQ0 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Aldh3b1Q80VQ0 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Aldh3b1Q80VQ0 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Aldh3b1Q80VQ0 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Aldh3b1Q80VQ0 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Aldh3b1Q80VQ0 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Aldh3b1Q80VQ0 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Aldh3b1Q80VQ0 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Aldh3b1Q80VQ0 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Aldh3b1Q80VQ0 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Aldh3b1Q80VQ0 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Aldh3b1Q80VQ0 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Aldh3b1Q80VQ0 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Aldh3b1Q80VQ0 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Aldh3b1Q80VQ0 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Aldh3b1Q80VQ0 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Aldh3b1Q80VQ0 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Aldh3b1Q80VQ0 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Aldh3b1Q80VQ0 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Aldh3b1Q80VQ0 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Aldh3b1Q80VQ0 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Aldh3b1Q80VQ0 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Aldh3b1Q80VQ0 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Aldh3b1Q80VQ0 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Aldh3b1Q80VQ0 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Aldh3b1Q80VQ0 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Aldh3b1Q80VQ0 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Aldh3b1Q80VQ0 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Aldh3b1Q80VQ0 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Aldh3b1Q80VQ0 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Aldh3b1Q80VQ0 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Aldh3b1Q80VQ0 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Aldh3b1Q80VQ0 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Aldh3b1Q80VQ0 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Aldh3b1Q80VQ0 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Aldh3b1Q80VQ0 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Aldh3b1Q80VQ0 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Aldh3b1Q80VQ0 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Aldh3b1Q80VQ0 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Aldh3b1Q80VQ0 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Aldh3b1Q80VQ0 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Aldh3b1Q80VQ0 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Aldh3b1Q80VQ0 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Aldh3b1Q80VQ0 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Aldh3b1Q80VQ0 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Aldh3b1Q80VQ0 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Aldh3b1Q80VQ0 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Aldh3b1Q80VQ0 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Aldh3b1Q80VQ0 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Aldh3b1Q80VQ0 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Aldh3b1Q80VQ0 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Aldh3b1Q80VQ0 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Aldh3b1Q80VQ0 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Aldh3b1Q80VQ0 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Aldh3b1Q80VQ0 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Aldh3b1Q80VQ0 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Aldh3b1Q80VQ0 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Aldh3b1Q80VQ0 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Aldh3b1Q80VQ0 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Aldh3b1Q80VQ0 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Aldh3b1Q80VQ0 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Aldh3b1Q80VQ0 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Aldh3b1Q80VQ0 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Aldh3b1Q80VQ0 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Aldh3b1Q80VQ0 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Aldh3b1Q80VQ0 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Aldh3b1Q80VQ0 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Aldh3b1Q80VQ0 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Aldh3b1Q80VQ0 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Aldh3b1Q80VQ0 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Aldh3b1Q80VQ0 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Aldh3b1Q80VQ0 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Aldh3b1Q80VQ0 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Aldh3b1Q80VQ0 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Aldh3b1Q80VQ0 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Aldh3b1Q80VQ0 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Aldh3b1Q80VQ0 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Aldh3b1Q80VQ0 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Aldh3b1Q80VQ0 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Aldh3b1Q80VQ0 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Aldh3b1Q80VQ0 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Aldh3b1Q80VQ0 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Aldh3b1Q80VQ0 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Aldh3b1Q80VQ0 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Aldh3b1Q80VQ0 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Aldh3b1Q80VQ0 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Aldh3b1Q80VQ0 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Aldh3b1Q80VQ0 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Aldh3b1Q80VQ0 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Aldh3b1Q80VQ0 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Aldh3b1Q80VQ0 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms