Protein–RNA interactions for Protein: Q80ST9

Lca5, Lebercilin, mousemouse

Predictions only

Length 704 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lca5Q80ST9 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lca5Q80ST9 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lca5Q80ST9 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Lca5Q80ST9 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Lca5Q80ST9 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Lca5Q80ST9 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Lca5Q80ST9 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Lca5Q80ST9 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Lca5Q80ST9 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Lca5Q80ST9 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Lca5Q80ST9 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lca5Q80ST9 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lca5Q80ST9 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lca5Q80ST9 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lca5Q80ST9 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lca5Q80ST9 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lca5Q80ST9 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lca5Q80ST9 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lca5Q80ST9 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lca5Q80ST9 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lca5Q80ST9 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lca5Q80ST9 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lca5Q80ST9 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lca5Q80ST9 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lca5Q80ST9 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lca5Q80ST9 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Lca5Q80ST9 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lca5Q80ST9 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lca5Q80ST9 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lca5Q80ST9 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lca5Q80ST9 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Lca5Q80ST9 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lca5Q80ST9 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lca5Q80ST9 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lca5Q80ST9 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lca5Q80ST9 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lca5Q80ST9 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lca5Q80ST9 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lca5Q80ST9 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lca5Q80ST9 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lca5Q80ST9 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lca5Q80ST9 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lca5Q80ST9 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lca5Q80ST9 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lca5Q80ST9 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lca5Q80ST9 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lca5Q80ST9 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lca5Q80ST9 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lca5Q80ST9 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lca5Q80ST9 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lca5Q80ST9 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lca5Q80ST9 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lca5Q80ST9 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lca5Q80ST9 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lca5Q80ST9 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lca5Q80ST9 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lca5Q80ST9 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lca5Q80ST9 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lca5Q80ST9 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lca5Q80ST9 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lca5Q80ST9 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lca5Q80ST9 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lca5Q80ST9 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lca5Q80ST9 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Lca5Q80ST9 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lca5Q80ST9 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lca5Q80ST9 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lca5Q80ST9 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lca5Q80ST9 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lca5Q80ST9 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lca5Q80ST9 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Lca5Q80ST9 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lca5Q80ST9 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lca5Q80ST9 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lca5Q80ST9 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lca5Q80ST9 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lca5Q80ST9 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Lca5Q80ST9 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lca5Q80ST9 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lca5Q80ST9 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Lca5Q80ST9 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lca5Q80ST9 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lca5Q80ST9 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lca5Q80ST9 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lca5Q80ST9 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lca5Q80ST9 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lca5Q80ST9 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lca5Q80ST9 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lca5Q80ST9 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lca5Q80ST9 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Lca5Q80ST9 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Lca5Q80ST9 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lca5Q80ST9 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lca5Q80ST9 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Lca5Q80ST9 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lca5Q80ST9 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lca5Q80ST9 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lca5Q80ST9 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lca5Q80ST9 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lca5Q80ST9 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms