Protein–RNA interactions for Protein: Q7TST5

Lamp3, Lysosome-associated membrane glycoprotein 3, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamp3Q7TST5 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lamp3Q7TST5 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lamp3Q7TST5 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lamp3Q7TST5 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lamp3Q7TST5 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lamp3Q7TST5 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lamp3Q7TST5 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lamp3Q7TST5 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lamp3Q7TST5 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lamp3Q7TST5 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lamp3Q7TST5 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lamp3Q7TST5 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lamp3Q7TST5 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lamp3Q7TST5 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lamp3Q7TST5 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lamp3Q7TST5 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lamp3Q7TST5 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lamp3Q7TST5 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lamp3Q7TST5 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lamp3Q7TST5 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lamp3Q7TST5 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lamp3Q7TST5 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lamp3Q7TST5 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lamp3Q7TST5 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lamp3Q7TST5 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lamp3Q7TST5 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lamp3Q7TST5 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lamp3Q7TST5 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lamp3Q7TST5 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lamp3Q7TST5 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lamp3Q7TST5 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Lamp3Q7TST5 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lamp3Q7TST5 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lamp3Q7TST5 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lamp3Q7TST5 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lamp3Q7TST5 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lamp3Q7TST5 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lamp3Q7TST5 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lamp3Q7TST5 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lamp3Q7TST5 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lamp3Q7TST5 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lamp3Q7TST5 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lamp3Q7TST5 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lamp3Q7TST5 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lamp3Q7TST5 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Lamp3Q7TST5 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lamp3Q7TST5 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lamp3Q7TST5 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lamp3Q7TST5 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lamp3Q7TST5 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lamp3Q7TST5 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lamp3Q7TST5 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lamp3Q7TST5 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lamp3Q7TST5 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lamp3Q7TST5 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lamp3Q7TST5 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lamp3Q7TST5 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lamp3Q7TST5 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lamp3Q7TST5 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lamp3Q7TST5 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lamp3Q7TST5 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Lamp3Q7TST5 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lamp3Q7TST5 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lamp3Q7TST5 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lamp3Q7TST5 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lamp3Q7TST5 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lamp3Q7TST5 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lamp3Q7TST5 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lamp3Q7TST5 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lamp3Q7TST5 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lamp3Q7TST5 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lamp3Q7TST5 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lamp3Q7TST5 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lamp3Q7TST5 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lamp3Q7TST5 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lamp3Q7TST5 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lamp3Q7TST5 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lamp3Q7TST5 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lamp3Q7TST5 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lamp3Q7TST5 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lamp3Q7TST5 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lamp3Q7TST5 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Lamp3Q7TST5 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lamp3Q7TST5 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lamp3Q7TST5 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Lamp3Q7TST5 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lamp3Q7TST5 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lamp3Q7TST5 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lamp3Q7TST5 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lamp3Q7TST5 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lamp3Q7TST5 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lamp3Q7TST5 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lamp3Q7TST5 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lamp3Q7TST5 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lamp3Q7TST5 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lamp3Q7TST5 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lamp3Q7TST5 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lamp3Q7TST5 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lamp3Q7TST5 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lamp3Q7TST5 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms