Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF0

Dsg1c, Desmoglein-1-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1cQ7TSF0 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Dsg1cQ7TSF0 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Dsg1cQ7TSF0 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Dsg1cQ7TSF0 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Dsg1cQ7TSF0 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Dsg1cQ7TSF0 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Dsg1cQ7TSF0 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Dsg1cQ7TSF0 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Dsg1cQ7TSF0 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Dsg1cQ7TSF0 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Dsg1cQ7TSF0 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Dsg1cQ7TSF0 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Dsg1cQ7TSF0 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Dsg1cQ7TSF0 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Dsg1cQ7TSF0 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Dsg1cQ7TSF0 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Dsg1cQ7TSF0 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Dsg1cQ7TSF0 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Dsg1cQ7TSF0 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Dsg1cQ7TSF0 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Dsg1cQ7TSF0 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Dsg1cQ7TSF0 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Dsg1cQ7TSF0 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Dsg1cQ7TSF0 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Dsg1cQ7TSF0 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Dsg1cQ7TSF0 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Dsg1cQ7TSF0 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Dsg1cQ7TSF0 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Dsg1cQ7TSF0 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Dsg1cQ7TSF0 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Dsg1cQ7TSF0 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Dsg1cQ7TSF0 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Dsg1cQ7TSF0 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Dsg1cQ7TSF0 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Dsg1cQ7TSF0 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Dsg1cQ7TSF0 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Dsg1cQ7TSF0 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Dsg1cQ7TSF0 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Dsg1cQ7TSF0 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Dsg1cQ7TSF0 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Dsg1cQ7TSF0 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Dsg1cQ7TSF0 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Dsg1cQ7TSF0 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Dsg1cQ7TSF0 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Dsg1cQ7TSF0 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Dsg1cQ7TSF0 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Dsg1cQ7TSF0 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Dsg1cQ7TSF0 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Dsg1cQ7TSF0 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Dsg1cQ7TSF0 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Dsg1cQ7TSF0 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Dsg1cQ7TSF0 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Dsg1cQ7TSF0 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Dsg1cQ7TSF0 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Dsg1cQ7TSF0 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Dsg1cQ7TSF0 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Dsg1cQ7TSF0 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Dsg1cQ7TSF0 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Dsg1cQ7TSF0 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Dsg1cQ7TSF0 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Dsg1cQ7TSF0 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Dsg1cQ7TSF0 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Dsg1cQ7TSF0 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Dsg1cQ7TSF0 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Dsg1cQ7TSF0 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Dsg1cQ7TSF0 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Dsg1cQ7TSF0 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Dsg1cQ7TSF0 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Dsg1cQ7TSF0 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Dsg1cQ7TSF0 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Dsg1cQ7TSF0 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Dsg1cQ7TSF0 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Dsg1cQ7TSF0 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Dsg1cQ7TSF0 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Dsg1cQ7TSF0 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Dsg1cQ7TSF0 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Dsg1cQ7TSF0 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Dsg1cQ7TSF0 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Dsg1cQ7TSF0 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Dsg1cQ7TSF0 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Dsg1cQ7TSF0 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Dsg1cQ7TSF0 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Dsg1cQ7TSF0 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Dsg1cQ7TSF0 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Dsg1cQ7TSF0 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Dsg1cQ7TSF0 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Dsg1cQ7TSF0 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Dsg1cQ7TSF0 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Dsg1cQ7TSF0 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Dsg1cQ7TSF0 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Dsg1cQ7TSF0 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Dsg1cQ7TSF0 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Dsg1cQ7TSF0 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Dsg1cQ7TSF0 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Dsg1cQ7TSF0 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Dsg1cQ7TSF0 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Dsg1cQ7TSF0 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Dsg1cQ7TSF0 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Dsg1cQ7TSF0 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Dsg1cQ7TSF0 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms