Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSC3

Nek5, Serine/threonine-protein kinase Nek5, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek5Q7TSC3 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nek5Q7TSC3 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nek5Q7TSC3 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nek5Q7TSC3 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nek5Q7TSC3 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nek5Q7TSC3 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nek5Q7TSC3 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nek5Q7TSC3 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Nek5Q7TSC3 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nek5Q7TSC3 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nek5Q7TSC3 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Nek5Q7TSC3 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Nek5Q7TSC3 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nek5Q7TSC3 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nek5Q7TSC3 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nek5Q7TSC3 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nek5Q7TSC3 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nek5Q7TSC3 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nek5Q7TSC3 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nek5Q7TSC3 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nek5Q7TSC3 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nek5Q7TSC3 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nek5Q7TSC3 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nek5Q7TSC3 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nek5Q7TSC3 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nek5Q7TSC3 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nek5Q7TSC3 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nek5Q7TSC3 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nek5Q7TSC3 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Nek5Q7TSC3 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Nek5Q7TSC3 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Nek5Q7TSC3 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nek5Q7TSC3 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nek5Q7TSC3 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nek5Q7TSC3 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nek5Q7TSC3 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nek5Q7TSC3 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nek5Q7TSC3 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nek5Q7TSC3 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nek5Q7TSC3 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nek5Q7TSC3 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Nek5Q7TSC3 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nek5Q7TSC3 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Nek5Q7TSC3 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nek5Q7TSC3 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nek5Q7TSC3 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nek5Q7TSC3 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nek5Q7TSC3 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nek5Q7TSC3 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nek5Q7TSC3 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nek5Q7TSC3 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Nek5Q7TSC3 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nek5Q7TSC3 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nek5Q7TSC3 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nek5Q7TSC3 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nek5Q7TSC3 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nek5Q7TSC3 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nek5Q7TSC3 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nek5Q7TSC3 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nek5Q7TSC3 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nek5Q7TSC3 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nek5Q7TSC3 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nek5Q7TSC3 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nek5Q7TSC3 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nek5Q7TSC3 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nek5Q7TSC3 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nek5Q7TSC3 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nek5Q7TSC3 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nek5Q7TSC3 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nek5Q7TSC3 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nek5Q7TSC3 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nek5Q7TSC3 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nek5Q7TSC3 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nek5Q7TSC3 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nek5Q7TSC3 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nek5Q7TSC3 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nek5Q7TSC3 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nek5Q7TSC3 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nek5Q7TSC3 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nek5Q7TSC3 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nek5Q7TSC3 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Nek5Q7TSC3 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nek5Q7TSC3 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nek5Q7TSC3 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Nek5Q7TSC3 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nek5Q7TSC3 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nek5Q7TSC3 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nek5Q7TSC3 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nek5Q7TSC3 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nek5Q7TSC3 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nek5Q7TSC3 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nek5Q7TSC3 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nek5Q7TSC3 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nek5Q7TSC3 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nek5Q7TSC3 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nek5Q7TSC3 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Nek5Q7TSC3 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Nek5Q7TSC3 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Nek5Q7TSC3 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Nek5Q7TSC3 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 186 ms