Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMS5

Abcg2, ATP-binding cassette sub-family G member 2, mousemouse

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcg2Q7TMS5 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Abcg2Q7TMS5 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Abcg2Q7TMS5 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Abcg2Q7TMS5 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Abcg2Q7TMS5 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Abcg2Q7TMS5 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Abcg2Q7TMS5 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Abcg2Q7TMS5 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Abcg2Q7TMS5 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Abcg2Q7TMS5 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Abcg2Q7TMS5 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Abcg2Q7TMS5 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Abcg2Q7TMS5 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Abcg2Q7TMS5 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Abcg2Q7TMS5 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Abcg2Q7TMS5 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Abcg2Q7TMS5 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Abcg2Q7TMS5 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Abcg2Q7TMS5 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Abcg2Q7TMS5 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Abcg2Q7TMS5 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Abcg2Q7TMS5 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Abcg2Q7TMS5 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Abcg2Q7TMS5 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Abcg2Q7TMS5 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Abcg2Q7TMS5 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Abcg2Q7TMS5 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Abcg2Q7TMS5 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Abcg2Q7TMS5 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Abcg2Q7TMS5 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Abcg2Q7TMS5 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Abcg2Q7TMS5 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Abcg2Q7TMS5 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Abcg2Q7TMS5 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Abcg2Q7TMS5 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Abcg2Q7TMS5 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Abcg2Q7TMS5 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Abcg2Q7TMS5 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Abcg2Q7TMS5 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Abcg2Q7TMS5 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Abcg2Q7TMS5 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Abcg2Q7TMS5 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Abcg2Q7TMS5 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Abcg2Q7TMS5 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Abcg2Q7TMS5 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Abcg2Q7TMS5 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Abcg2Q7TMS5 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Abcg2Q7TMS5 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Abcg2Q7TMS5 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Abcg2Q7TMS5 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Abcg2Q7TMS5 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Abcg2Q7TMS5 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Abcg2Q7TMS5 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Abcg2Q7TMS5 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Abcg2Q7TMS5 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Abcg2Q7TMS5 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Abcg2Q7TMS5 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Abcg2Q7TMS5 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Abcg2Q7TMS5 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Abcg2Q7TMS5 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Abcg2Q7TMS5 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Abcg2Q7TMS5 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Abcg2Q7TMS5 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Abcg2Q7TMS5 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Abcg2Q7TMS5 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Abcg2Q7TMS5 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Abcg2Q7TMS5 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Abcg2Q7TMS5 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Abcg2Q7TMS5 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Abcg2Q7TMS5 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Abcg2Q7TMS5 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Abcg2Q7TMS5 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Abcg2Q7TMS5 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Abcg2Q7TMS5 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Abcg2Q7TMS5 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Abcg2Q7TMS5 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Abcg2Q7TMS5 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Abcg2Q7TMS5 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Abcg2Q7TMS5 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Abcg2Q7TMS5 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Abcg2Q7TMS5 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Abcg2Q7TMS5 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Abcg2Q7TMS5 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Abcg2Q7TMS5 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Abcg2Q7TMS5 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Abcg2Q7TMS5 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Abcg2Q7TMS5 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Abcg2Q7TMS5 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Abcg2Q7TMS5 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Abcg2Q7TMS5 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Abcg2Q7TMS5 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Abcg2Q7TMS5 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Abcg2Q7TMS5 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Abcg2Q7TMS5 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Abcg2Q7TMS5 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Abcg2Q7TMS5 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Abcg2Q7TMS5 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Abcg2Q7TMS5 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Abcg2Q7TMS5 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Abcg2Q7TMS5 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms