Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMM9

Tubb2a, Tubulin beta-2A chain, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb2aQ7TMM9 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tubb2aQ7TMM9 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tubb2aQ7TMM9 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tubb2aQ7TMM9 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tubb2aQ7TMM9 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tubb2aQ7TMM9 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tubb2aQ7TMM9 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tubb2aQ7TMM9 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Tubb2aQ7TMM9 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tubb2aQ7TMM9 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tubb2aQ7TMM9 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tubb2aQ7TMM9 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tubb2aQ7TMM9 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tubb2aQ7TMM9 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tubb2aQ7TMM9 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tubb2aQ7TMM9 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tubb2aQ7TMM9 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tubb2aQ7TMM9 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tubb2aQ7TMM9 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tubb2aQ7TMM9 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tubb2aQ7TMM9 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tubb2aQ7TMM9 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tubb2aQ7TMM9 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tubb2aQ7TMM9 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tubb2aQ7TMM9 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tubb2aQ7TMM9 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tubb2aQ7TMM9 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tubb2aQ7TMM9 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Tubb2aQ7TMM9 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Tubb2aQ7TMM9 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tubb2aQ7TMM9 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tubb2aQ7TMM9 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tubb2aQ7TMM9 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tubb2aQ7TMM9 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tubb2aQ7TMM9 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tubb2aQ7TMM9 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tubb2aQ7TMM9 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tubb2aQ7TMM9 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tubb2aQ7TMM9 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tubb2aQ7TMM9 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tubb2aQ7TMM9 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tubb2aQ7TMM9 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tubb2aQ7TMM9 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tubb2aQ7TMM9 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tubb2aQ7TMM9 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tubb2aQ7TMM9 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Tubb2aQ7TMM9 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tubb2aQ7TMM9 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tubb2aQ7TMM9 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tubb2aQ7TMM9 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Tubb2aQ7TMM9 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tubb2aQ7TMM9 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Tubb2aQ7TMM9 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tubb2aQ7TMM9 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tubb2aQ7TMM9 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tubb2aQ7TMM9 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tubb2aQ7TMM9 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tubb2aQ7TMM9 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tubb2aQ7TMM9 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tubb2aQ7TMM9 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tubb2aQ7TMM9 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tubb2aQ7TMM9 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tubb2aQ7TMM9 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tubb2aQ7TMM9 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tubb2aQ7TMM9 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tubb2aQ7TMM9 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tubb2aQ7TMM9 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tubb2aQ7TMM9 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tubb2aQ7TMM9 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tubb2aQ7TMM9 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tubb2aQ7TMM9 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tubb2aQ7TMM9 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tubb2aQ7TMM9 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tubb2aQ7TMM9 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tubb2aQ7TMM9 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tubb2aQ7TMM9 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tubb2aQ7TMM9 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tubb2aQ7TMM9 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tubb2aQ7TMM9 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Tubb2aQ7TMM9 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Tubb2aQ7TMM9 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tubb2aQ7TMM9 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tubb2aQ7TMM9 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tubb2aQ7TMM9 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tubb2aQ7TMM9 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tubb2aQ7TMM9 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tubb2aQ7TMM9 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tubb2aQ7TMM9 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tubb2aQ7TMM9 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tubb2aQ7TMM9 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tubb2aQ7TMM9 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tubb2aQ7TMM9 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tubb2aQ7TMM9 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tubb2aQ7TMM9 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Tubb2aQ7TMM9 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tubb2aQ7TMM9 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Tubb2aQ7TMM9 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tubb2aQ7TMM9 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tubb2aQ7TMM9 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tubb2aQ7TMM9 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms