Protein–RNA interactions for Protein: Q78RX3

Smim12, Small integral membrane protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim12Q78RX3 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Smim12Q78RX3 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Smim12Q78RX3 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Smim12Q78RX3 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Smim12Q78RX3 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Smim12Q78RX3 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Smim12Q78RX3 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Smim12Q78RX3 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Smim12Q78RX3 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Smim12Q78RX3 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Smim12Q78RX3 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Smim12Q78RX3 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Smim12Q78RX3 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Smim12Q78RX3 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Smim12Q78RX3 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Smim12Q78RX3 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Smim12Q78RX3 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Smim12Q78RX3 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smim12Q78RX3 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smim12Q78RX3 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smim12Q78RX3 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smim12Q78RX3 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smim12Q78RX3 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smim12Q78RX3 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smim12Q78RX3 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smim12Q78RX3 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Smim12Q78RX3 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Smim12Q78RX3 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Smim12Q78RX3 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Smim12Q78RX3 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Smim12Q78RX3 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Smim12Q78RX3 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Smim12Q78RX3 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Smim12Q78RX3 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Smim12Q78RX3 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Smim12Q78RX3 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Smim12Q78RX3 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Smim12Q78RX3 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Smim12Q78RX3 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Smim12Q78RX3 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Smim12Q78RX3 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Smim12Q78RX3 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Smim12Q78RX3 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Smim12Q78RX3 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Smim12Q78RX3 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Smim12Q78RX3 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Smim12Q78RX3 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Smim12Q78RX3 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Smim12Q78RX3 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Smim12Q78RX3 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Smim12Q78RX3 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Smim12Q78RX3 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Smim12Q78RX3 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Smim12Q78RX3 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Smim12Q78RX3 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Smim12Q78RX3 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Smim12Q78RX3 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Smim12Q78RX3 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Smim12Q78RX3 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Smim12Q78RX3 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Smim12Q78RX3 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Smim12Q78RX3 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Smim12Q78RX3 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Smim12Q78RX3 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Smim12Q78RX3 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Smim12Q78RX3 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Smim12Q78RX3 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Smim12Q78RX3 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Smim12Q78RX3 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Smim12Q78RX3 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Smim12Q78RX3 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Smim12Q78RX3 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Smim12Q78RX3 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Smim12Q78RX3 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Smim12Q78RX3 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Smim12Q78RX3 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Smim12Q78RX3 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Smim12Q78RX3 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Smim12Q78RX3 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Smim12Q78RX3 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Smim12Q78RX3 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Smim12Q78RX3 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Smim12Q78RX3 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Smim12Q78RX3 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Smim12Q78RX3 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Smim12Q78RX3 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Smim12Q78RX3 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Smim12Q78RX3 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Smim12Q78RX3 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Smim12Q78RX3 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Smim12Q78RX3 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Smim12Q78RX3 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Smim12Q78RX3 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Smim12Q78RX3 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Smim12Q78RX3 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Smim12Q78RX3 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Smim12Q78RX3 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Smim12Q78RX3 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Smim12Q78RX3 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Smim12Q78RX3 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms