Protein–RNA interactions for Protein: Q78JN3

Eci3, Enoyl-CoA delta isomerase 3, peroxisomal, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eci3Q78JN3 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Eci3Q78JN3 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Eci3Q78JN3 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Eci3Q78JN3 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Eci3Q78JN3 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Eci3Q78JN3 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Eci3Q78JN3 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Eci3Q78JN3 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Eci3Q78JN3 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Eci3Q78JN3 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Eci3Q78JN3 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Eci3Q78JN3 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Eci3Q78JN3 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Eci3Q78JN3 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Eci3Q78JN3 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Eci3Q78JN3 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Eci3Q78JN3 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Eci3Q78JN3 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Eci3Q78JN3 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Eci3Q78JN3 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Eci3Q78JN3 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Eci3Q78JN3 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Eci3Q78JN3 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Eci3Q78JN3 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Eci3Q78JN3 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Eci3Q78JN3 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Eci3Q78JN3 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Eci3Q78JN3 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Eci3Q78JN3 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Eci3Q78JN3 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Eci3Q78JN3 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Eci3Q78JN3 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Eci3Q78JN3 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Eci3Q78JN3 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Eci3Q78JN3 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Eci3Q78JN3 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Eci3Q78JN3 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Eci3Q78JN3 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Eci3Q78JN3 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Eci3Q78JN3 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Eci3Q78JN3 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Eci3Q78JN3 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Eci3Q78JN3 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Eci3Q78JN3 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Eci3Q78JN3 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Eci3Q78JN3 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Eci3Q78JN3 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Eci3Q78JN3 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Eci3Q78JN3 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Eci3Q78JN3 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Eci3Q78JN3 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Eci3Q78JN3 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Eci3Q78JN3 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Eci3Q78JN3 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Eci3Q78JN3 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Eci3Q78JN3 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Eci3Q78JN3 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Eci3Q78JN3 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Eci3Q78JN3 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Eci3Q78JN3 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Eci3Q78JN3 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Eci3Q78JN3 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Eci3Q78JN3 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Eci3Q78JN3 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Eci3Q78JN3 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Eci3Q78JN3 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Eci3Q78JN3 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Eci3Q78JN3 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Eci3Q78JN3 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Eci3Q78JN3 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Eci3Q78JN3 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Eci3Q78JN3 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Eci3Q78JN3 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Eci3Q78JN3 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Eci3Q78JN3 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Eci3Q78JN3 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Eci3Q78JN3 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Eci3Q78JN3 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Eci3Q78JN3 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Eci3Q78JN3 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Eci3Q78JN3 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Eci3Q78JN3 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Eci3Q78JN3 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Eci3Q78JN3 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Eci3Q78JN3 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Eci3Q78JN3 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Eci3Q78JN3 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Eci3Q78JN3 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Eci3Q78JN3 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Eci3Q78JN3 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Eci3Q78JN3 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Eci3Q78JN3 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Eci3Q78JN3 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Eci3Q78JN3 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Eci3Q78JN3 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Eci3Q78JN3 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Eci3Q78JN3 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Eci3Q78JN3 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Eci3Q78JN3 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Eci3Q78JN3 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms