Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQH8

Nup188, Nucleoporin NUP188 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup188Q6ZQH8 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Nup188Q6ZQH8 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Nup188Q6ZQH8 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Nup188Q6ZQH8 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Nup188Q6ZQH8 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Nup188Q6ZQH8 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Nup188Q6ZQH8 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Nup188Q6ZQH8 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Nup188Q6ZQH8 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Nup188Q6ZQH8 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Nup188Q6ZQH8 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Nup188Q6ZQH8 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Nup188Q6ZQH8 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Nup188Q6ZQH8 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Nup188Q6ZQH8 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Nup188Q6ZQH8 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Nup188Q6ZQH8 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Nup188Q6ZQH8 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Nup188Q6ZQH8 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Nup188Q6ZQH8 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Nup188Q6ZQH8 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Nup188Q6ZQH8 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Nup188Q6ZQH8 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Nup188Q6ZQH8 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Nup188Q6ZQH8 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Nup188Q6ZQH8 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Nup188Q6ZQH8 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Nup188Q6ZQH8 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nup188Q6ZQH8 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nup188Q6ZQH8 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nup188Q6ZQH8 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nup188Q6ZQH8 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nup188Q6ZQH8 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Nup188Q6ZQH8 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Nup188Q6ZQH8 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Nup188Q6ZQH8 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Nup188Q6ZQH8 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Nup188Q6ZQH8 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Nup188Q6ZQH8 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Nup188Q6ZQH8 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Nup188Q6ZQH8 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Nup188Q6ZQH8 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Nup188Q6ZQH8 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Nup188Q6ZQH8 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Nup188Q6ZQH8 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Nup188Q6ZQH8 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Nup188Q6ZQH8 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Nup188Q6ZQH8 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Nup188Q6ZQH8 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Nup188Q6ZQH8 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Nup188Q6ZQH8 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Nup188Q6ZQH8 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Nup188Q6ZQH8 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Nup188Q6ZQH8 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Nup188Q6ZQH8 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Nup188Q6ZQH8 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Nup188Q6ZQH8 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Nup188Q6ZQH8 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Nup188Q6ZQH8 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Nup188Q6ZQH8 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Nup188Q6ZQH8 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Nup188Q6ZQH8 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Nup188Q6ZQH8 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Nup188Q6ZQH8 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Nup188Q6ZQH8 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Nup188Q6ZQH8 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Nup188Q6ZQH8 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Nup188Q6ZQH8 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Nup188Q6ZQH8 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Nup188Q6ZQH8 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Nup188Q6ZQH8 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Nup188Q6ZQH8 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Nup188Q6ZQH8 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Nup188Q6ZQH8 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Nup188Q6ZQH8 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Nup188Q6ZQH8 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Nup188Q6ZQH8 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Nup188Q6ZQH8 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Nup188Q6ZQH8 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Nup188Q6ZQH8 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Nup188Q6ZQH8 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Nup188Q6ZQH8 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Nup188Q6ZQH8 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Nup188Q6ZQH8 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Nup188Q6ZQH8 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Nup188Q6ZQH8 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Nup188Q6ZQH8 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Nup188Q6ZQH8 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Nup188Q6ZQH8 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Nup188Q6ZQH8 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Nup188Q6ZQH8 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Nup188Q6ZQH8 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Nup188Q6ZQH8 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Nup188Q6ZQH8 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Nup188Q6ZQH8 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Nup188Q6ZQH8 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Nup188Q6ZQH8 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Nup188Q6ZQH8 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Nup188Q6ZQH8 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Nup188Q6ZQH8 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms