Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ89

March6, E3 ubiquitin-protein ligase MARCH6, mousemouse

Predictions only

Length 909 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
March6Q6ZQ89 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
March6Q6ZQ89 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
March6Q6ZQ89 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
March6Q6ZQ89 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
March6Q6ZQ89 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
March6Q6ZQ89 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
March6Q6ZQ89 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
March6Q6ZQ89 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
March6Q6ZQ89 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
March6Q6ZQ89 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
March6Q6ZQ89 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
March6Q6ZQ89 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
March6Q6ZQ89 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
March6Q6ZQ89 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
March6Q6ZQ89 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
March6Q6ZQ89 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
March6Q6ZQ89 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
March6Q6ZQ89 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
March6Q6ZQ89 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
March6Q6ZQ89 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
March6Q6ZQ89 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
March6Q6ZQ89 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
March6Q6ZQ89 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
March6Q6ZQ89 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
March6Q6ZQ89 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
March6Q6ZQ89 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
March6Q6ZQ89 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
March6Q6ZQ89 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
March6Q6ZQ89 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
March6Q6ZQ89 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
March6Q6ZQ89 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
March6Q6ZQ89 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
March6Q6ZQ89 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
March6Q6ZQ89 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
March6Q6ZQ89 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
March6Q6ZQ89 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
March6Q6ZQ89 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
March6Q6ZQ89 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
March6Q6ZQ89 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
March6Q6ZQ89 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
March6Q6ZQ89 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
March6Q6ZQ89 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
March6Q6ZQ89 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
March6Q6ZQ89 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
March6Q6ZQ89 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
March6Q6ZQ89 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
March6Q6ZQ89 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
March6Q6ZQ89 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
March6Q6ZQ89 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
March6Q6ZQ89 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
March6Q6ZQ89 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
March6Q6ZQ89 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
March6Q6ZQ89 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
March6Q6ZQ89 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
March6Q6ZQ89 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
March6Q6ZQ89 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
March6Q6ZQ89 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
March6Q6ZQ89 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
March6Q6ZQ89 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
March6Q6ZQ89 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
March6Q6ZQ89 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
March6Q6ZQ89 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
March6Q6ZQ89 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
March6Q6ZQ89 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
March6Q6ZQ89 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
March6Q6ZQ89 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
March6Q6ZQ89 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
March6Q6ZQ89 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
March6Q6ZQ89 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
March6Q6ZQ89 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
March6Q6ZQ89 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
March6Q6ZQ89 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
March6Q6ZQ89 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
March6Q6ZQ89 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
March6Q6ZQ89 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
March6Q6ZQ89 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
March6Q6ZQ89 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
March6Q6ZQ89 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
March6Q6ZQ89 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
March6Q6ZQ89 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
March6Q6ZQ89 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
March6Q6ZQ89 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
March6Q6ZQ89 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
March6Q6ZQ89 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
March6Q6ZQ89 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
March6Q6ZQ89 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
March6Q6ZQ89 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
March6Q6ZQ89 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
March6Q6ZQ89 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
March6Q6ZQ89 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
March6Q6ZQ89 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
March6Q6ZQ89 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
March6Q6ZQ89 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
March6Q6ZQ89 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
March6Q6ZQ89 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
March6Q6ZQ89 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
March6Q6ZQ89 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
March6Q6ZQ89 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
March6Q6ZQ89 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
March6Q6ZQ89 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms