Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ03

Fnbp4, Formin-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,031 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fnbp4Q6ZQ03 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Fnbp4Q6ZQ03 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Fnbp4Q6ZQ03 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Fnbp4Q6ZQ03 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Fnbp4Q6ZQ03 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Fnbp4Q6ZQ03 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Fnbp4Q6ZQ03 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Fnbp4Q6ZQ03 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
Fnbp4Q6ZQ03 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Fnbp4Q6ZQ03 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Fnbp4Q6ZQ03 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Fnbp4Q6ZQ03 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Fnbp4Q6ZQ03 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Fnbp4Q6ZQ03 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Fnbp4Q6ZQ03 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Fnbp4Q6ZQ03 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Fnbp4Q6ZQ03 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Fnbp4Q6ZQ03 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Fnbp4Q6ZQ03 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Fnbp4Q6ZQ03 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Fnbp4Q6ZQ03 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Fnbp4Q6ZQ03 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Fnbp4Q6ZQ03 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Fnbp4Q6ZQ03 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Fnbp4Q6ZQ03 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Fnbp4Q6ZQ03 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Fnbp4Q6ZQ03 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Fnbp4Q6ZQ03 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Fnbp4Q6ZQ03 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Fnbp4Q6ZQ03 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Fnbp4Q6ZQ03 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Fnbp4Q6ZQ03 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Fnbp4Q6ZQ03 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Fnbp4Q6ZQ03 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Fnbp4Q6ZQ03 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Fnbp4Q6ZQ03 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Fnbp4Q6ZQ03 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Fnbp4Q6ZQ03 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Fnbp4Q6ZQ03 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Fnbp4Q6ZQ03 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Fnbp4Q6ZQ03 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Fnbp4Q6ZQ03 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Fnbp4Q6ZQ03 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Fnbp4Q6ZQ03 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Fnbp4Q6ZQ03 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Fnbp4Q6ZQ03 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Fnbp4Q6ZQ03 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Fnbp4Q6ZQ03 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Fnbp4Q6ZQ03 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Fnbp4Q6ZQ03 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Fnbp4Q6ZQ03 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Fnbp4Q6ZQ03 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Fnbp4Q6ZQ03 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Fnbp4Q6ZQ03 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Fnbp4Q6ZQ03 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Fnbp4Q6ZQ03 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Fnbp4Q6ZQ03 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Fnbp4Q6ZQ03 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Fnbp4Q6ZQ03 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Fnbp4Q6ZQ03 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Fnbp4Q6ZQ03 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Fnbp4Q6ZQ03 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Fnbp4Q6ZQ03 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Fnbp4Q6ZQ03 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Fnbp4Q6ZQ03 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Fnbp4Q6ZQ03 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Fnbp4Q6ZQ03 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Fnbp4Q6ZQ03 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.96
Fnbp4Q6ZQ03 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Fnbp4Q6ZQ03 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Fnbp4Q6ZQ03 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Fnbp4Q6ZQ03 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Fnbp4Q6ZQ03 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Fnbp4Q6ZQ03 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Fnbp4Q6ZQ03 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Fnbp4Q6ZQ03 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Fnbp4Q6ZQ03 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Fnbp4Q6ZQ03 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Fnbp4Q6ZQ03 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Fnbp4Q6ZQ03 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Fnbp4Q6ZQ03 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Fnbp4Q6ZQ03 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Fnbp4Q6ZQ03 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Fnbp4Q6ZQ03 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Fnbp4Q6ZQ03 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Fnbp4Q6ZQ03 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Fnbp4Q6ZQ03 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Fnbp4Q6ZQ03 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Fnbp4Q6ZQ03 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Fnbp4Q6ZQ03 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Fnbp4Q6ZQ03 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Fnbp4Q6ZQ03 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Fnbp4Q6ZQ03 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Fnbp4Q6ZQ03 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Fnbp4Q6ZQ03 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Fnbp4Q6ZQ03 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Fnbp4Q6ZQ03 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Fnbp4Q6ZQ03 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Fnbp4Q6ZQ03 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Fnbp4Q6ZQ03 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms