Protein–RNA interactions for Protein: Q6YND2

Znf653, Zinc finger protein 653, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf653Q6YND2 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Znf653Q6YND2 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Znf653Q6YND2 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Znf653Q6YND2 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Znf653Q6YND2 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Znf653Q6YND2 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Znf653Q6YND2 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Znf653Q6YND2 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Znf653Q6YND2 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Znf653Q6YND2 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Znf653Q6YND2 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Znf653Q6YND2 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Znf653Q6YND2 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Znf653Q6YND2 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Znf653Q6YND2 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Znf653Q6YND2 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Znf653Q6YND2 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Znf653Q6YND2 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Znf653Q6YND2 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Znf653Q6YND2 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Znf653Q6YND2 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Znf653Q6YND2 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Znf653Q6YND2 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Znf653Q6YND2 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Znf653Q6YND2 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Znf653Q6YND2 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Znf653Q6YND2 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Znf653Q6YND2 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Znf653Q6YND2 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Znf653Q6YND2 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Znf653Q6YND2 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Znf653Q6YND2 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Znf653Q6YND2 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Znf653Q6YND2 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Znf653Q6YND2 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Znf653Q6YND2 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Znf653Q6YND2 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Znf653Q6YND2 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Znf653Q6YND2 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Znf653Q6YND2 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Znf653Q6YND2 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Znf653Q6YND2 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Znf653Q6YND2 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Znf653Q6YND2 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Znf653Q6YND2 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Znf653Q6YND2 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Znf653Q6YND2 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Znf653Q6YND2 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Znf653Q6YND2 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Znf653Q6YND2 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Znf653Q6YND2 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Znf653Q6YND2 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Znf653Q6YND2 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Znf653Q6YND2 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Znf653Q6YND2 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Znf653Q6YND2 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Znf653Q6YND2 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Znf653Q6YND2 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Znf653Q6YND2 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Znf653Q6YND2 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Znf653Q6YND2 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Znf653Q6YND2 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Znf653Q6YND2 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Znf653Q6YND2 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Znf653Q6YND2 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Znf653Q6YND2 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Znf653Q6YND2 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Znf653Q6YND2 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Znf653Q6YND2 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Znf653Q6YND2 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Znf653Q6YND2 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Znf653Q6YND2 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Znf653Q6YND2 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Znf653Q6YND2 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Znf653Q6YND2 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Znf653Q6YND2 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Znf653Q6YND2 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Znf653Q6YND2 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Znf653Q6YND2 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Znf653Q6YND2 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Znf653Q6YND2 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Znf653Q6YND2 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Znf653Q6YND2 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Znf653Q6YND2 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Znf653Q6YND2 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Znf653Q6YND2 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Znf653Q6YND2 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Znf653Q6YND2 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Znf653Q6YND2 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Znf653Q6YND2 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Znf653Q6YND2 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Znf653Q6YND2 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Znf653Q6YND2 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Znf653Q6YND2 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Znf653Q6YND2 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Znf653Q6YND2 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Znf653Q6YND2 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Znf653Q6YND2 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Znf653Q6YND2 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Znf653Q6YND2 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms