Protein–RNA interactions for Protein: Q6XVG2

Cyp2c54, Cytochrome P450 2C54, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp2c54Q6XVG2 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cyp2c54Q6XVG2 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cyp2c54Q6XVG2 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Cyp2c54Q6XVG2 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Cyp2c54Q6XVG2 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cyp2c54Q6XVG2 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cyp2c54Q6XVG2 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Cyp2c54Q6XVG2 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cyp2c54Q6XVG2 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cyp2c54Q6XVG2 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cyp2c54Q6XVG2 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cyp2c54Q6XVG2 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cyp2c54Q6XVG2 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cyp2c54Q6XVG2 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cyp2c54Q6XVG2 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cyp2c54Q6XVG2 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cyp2c54Q6XVG2 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cyp2c54Q6XVG2 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cyp2c54Q6XVG2 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Cyp2c54Q6XVG2 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cyp2c54Q6XVG2 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cyp2c54Q6XVG2 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cyp2c54Q6XVG2 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cyp2c54Q6XVG2 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cyp2c54Q6XVG2 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cyp2c54Q6XVG2 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cyp2c54Q6XVG2 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cyp2c54Q6XVG2 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cyp2c54Q6XVG2 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cyp2c54Q6XVG2 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cyp2c54Q6XVG2 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Cyp2c54Q6XVG2 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cyp2c54Q6XVG2 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cyp2c54Q6XVG2 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cyp2c54Q6XVG2 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cyp2c54Q6XVG2 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cyp2c54Q6XVG2 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cyp2c54Q6XVG2 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cyp2c54Q6XVG2 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cyp2c54Q6XVG2 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cyp2c54Q6XVG2 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cyp2c54Q6XVG2 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cyp2c54Q6XVG2 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cyp2c54Q6XVG2 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cyp2c54Q6XVG2 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cyp2c54Q6XVG2 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cyp2c54Q6XVG2 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cyp2c54Q6XVG2 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cyp2c54Q6XVG2 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cyp2c54Q6XVG2 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cyp2c54Q6XVG2 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cyp2c54Q6XVG2 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Cyp2c54Q6XVG2 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cyp2c54Q6XVG2 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cyp2c54Q6XVG2 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cyp2c54Q6XVG2 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cyp2c54Q6XVG2 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cyp2c54Q6XVG2 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cyp2c54Q6XVG2 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cyp2c54Q6XVG2 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cyp2c54Q6XVG2 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cyp2c54Q6XVG2 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cyp2c54Q6XVG2 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Cyp2c54Q6XVG2 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cyp2c54Q6XVG2 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cyp2c54Q6XVG2 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cyp2c54Q6XVG2 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cyp2c54Q6XVG2 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cyp2c54Q6XVG2 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cyp2c54Q6XVG2 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cyp2c54Q6XVG2 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cyp2c54Q6XVG2 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cyp2c54Q6XVG2 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cyp2c54Q6XVG2 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cyp2c54Q6XVG2 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cyp2c54Q6XVG2 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cyp2c54Q6XVG2 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cyp2c54Q6XVG2 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cyp2c54Q6XVG2 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cyp2c54Q6XVG2 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cyp2c54Q6XVG2 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cyp2c54Q6XVG2 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cyp2c54Q6XVG2 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cyp2c54Q6XVG2 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cyp2c54Q6XVG2 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Cyp2c54Q6XVG2 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cyp2c54Q6XVG2 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cyp2c54Q6XVG2 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cyp2c54Q6XVG2 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cyp2c54Q6XVG2 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cyp2c54Q6XVG2 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cyp2c54Q6XVG2 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cyp2c54Q6XVG2 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cyp2c54Q6XVG2 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cyp2c54Q6XVG2 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cyp2c54Q6XVG2 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cyp2c54Q6XVG2 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cyp2c54Q6XVG2 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cyp2c54Q6XVG2 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cyp2c54Q6XVG2 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms