Protein–RNA interactions for Protein: Q6X1Y6

Asic3, Acid-sensing ion channel 3, mousemouse

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Asic3Q6X1Y6 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Asic3Q6X1Y6 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Asic3Q6X1Y6 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Asic3Q6X1Y6 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Asic3Q6X1Y6 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Asic3Q6X1Y6 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Asic3Q6X1Y6 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Asic3Q6X1Y6 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Asic3Q6X1Y6 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Asic3Q6X1Y6 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Asic3Q6X1Y6 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Asic3Q6X1Y6 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Asic3Q6X1Y6 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Asic3Q6X1Y6 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Asic3Q6X1Y6 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Asic3Q6X1Y6 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Asic3Q6X1Y6 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Asic3Q6X1Y6 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Asic3Q6X1Y6 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Asic3Q6X1Y6 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Asic3Q6X1Y6 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Asic3Q6X1Y6 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Asic3Q6X1Y6 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Asic3Q6X1Y6 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Asic3Q6X1Y6 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Asic3Q6X1Y6 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Asic3Q6X1Y6 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Asic3Q6X1Y6 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Asic3Q6X1Y6 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Asic3Q6X1Y6 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Asic3Q6X1Y6 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Asic3Q6X1Y6 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Asic3Q6X1Y6 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Asic3Q6X1Y6 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Asic3Q6X1Y6 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Asic3Q6X1Y6 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Asic3Q6X1Y6 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Asic3Q6X1Y6 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Asic3Q6X1Y6 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Asic3Q6X1Y6 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Asic3Q6X1Y6 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Asic3Q6X1Y6 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Asic3Q6X1Y6 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Asic3Q6X1Y6 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Asic3Q6X1Y6 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Asic3Q6X1Y6 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Asic3Q6X1Y6 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Asic3Q6X1Y6 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Asic3Q6X1Y6 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Asic3Q6X1Y6 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Asic3Q6X1Y6 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Asic3Q6X1Y6 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Asic3Q6X1Y6 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Asic3Q6X1Y6 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Asic3Q6X1Y6 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Asic3Q6X1Y6 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Asic3Q6X1Y6 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Asic3Q6X1Y6 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Asic3Q6X1Y6 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Asic3Q6X1Y6 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Asic3Q6X1Y6 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Asic3Q6X1Y6 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Asic3Q6X1Y6 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Asic3Q6X1Y6 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Asic3Q6X1Y6 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Asic3Q6X1Y6 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Asic3Q6X1Y6 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Asic3Q6X1Y6 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Asic3Q6X1Y6 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Asic3Q6X1Y6 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Asic3Q6X1Y6 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Asic3Q6X1Y6 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Asic3Q6X1Y6 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Asic3Q6X1Y6 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Asic3Q6X1Y6 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Asic3Q6X1Y6 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Asic3Q6X1Y6 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Asic3Q6X1Y6 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Asic3Q6X1Y6 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Asic3Q6X1Y6 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Asic3Q6X1Y6 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Asic3Q6X1Y6 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Asic3Q6X1Y6 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Asic3Q6X1Y6 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Asic3Q6X1Y6 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Asic3Q6X1Y6 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Asic3Q6X1Y6 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Asic3Q6X1Y6 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Asic3Q6X1Y6 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Asic3Q6X1Y6 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Asic3Q6X1Y6 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Asic3Q6X1Y6 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Asic3Q6X1Y6 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Asic3Q6X1Y6 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Asic3Q6X1Y6 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Asic3Q6X1Y6 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Asic3Q6X1Y6 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Asic3Q6X1Y6 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Asic3Q6X1Y6 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Asic3Q6X1Y6 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms