Protein–RNA interactions for Protein: Q6W5C0

Cxcl3, C-X-C motif chemokine 3, mousemouse

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl3Q6W5C0 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Cxcl3Q6W5C0 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cxcl3Q6W5C0 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cxcl3Q6W5C0 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cxcl3Q6W5C0 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cxcl3Q6W5C0 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cxcl3Q6W5C0 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cxcl3Q6W5C0 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cxcl3Q6W5C0 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cxcl3Q6W5C0 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Cxcl3Q6W5C0 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cxcl3Q6W5C0 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cxcl3Q6W5C0 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Cxcl3Q6W5C0 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cxcl3Q6W5C0 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cxcl3Q6W5C0 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Cxcl3Q6W5C0 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Cxcl3Q6W5C0 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cxcl3Q6W5C0 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cxcl3Q6W5C0 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cxcl3Q6W5C0 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cxcl3Q6W5C0 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cxcl3Q6W5C0 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cxcl3Q6W5C0 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cxcl3Q6W5C0 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cxcl3Q6W5C0 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cxcl3Q6W5C0 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cxcl3Q6W5C0 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cxcl3Q6W5C0 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cxcl3Q6W5C0 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cxcl3Q6W5C0 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cxcl3Q6W5C0 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Cxcl3Q6W5C0 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cxcl3Q6W5C0 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cxcl3Q6W5C0 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cxcl3Q6W5C0 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cxcl3Q6W5C0 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cxcl3Q6W5C0 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cxcl3Q6W5C0 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cxcl3Q6W5C0 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cxcl3Q6W5C0 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cxcl3Q6W5C0 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cxcl3Q6W5C0 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cxcl3Q6W5C0 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cxcl3Q6W5C0 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cxcl3Q6W5C0 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Cxcl3Q6W5C0 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cxcl3Q6W5C0 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cxcl3Q6W5C0 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cxcl3Q6W5C0 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cxcl3Q6W5C0 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cxcl3Q6W5C0 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cxcl3Q6W5C0 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cxcl3Q6W5C0 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cxcl3Q6W5C0 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cxcl3Q6W5C0 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cxcl3Q6W5C0 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cxcl3Q6W5C0 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cxcl3Q6W5C0 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cxcl3Q6W5C0 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cxcl3Q6W5C0 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Cxcl3Q6W5C0 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cxcl3Q6W5C0 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Cxcl3Q6W5C0 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cxcl3Q6W5C0 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cxcl3Q6W5C0 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cxcl3Q6W5C0 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cxcl3Q6W5C0 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cxcl3Q6W5C0 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Cxcl3Q6W5C0 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cxcl3Q6W5C0 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cxcl3Q6W5C0 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Cxcl3Q6W5C0 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Cxcl3Q6W5C0 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cxcl3Q6W5C0 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cxcl3Q6W5C0 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cxcl3Q6W5C0 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cxcl3Q6W5C0 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cxcl3Q6W5C0 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cxcl3Q6W5C0 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Cxcl3Q6W5C0 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cxcl3Q6W5C0 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Cxcl3Q6W5C0 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cxcl3Q6W5C0 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cxcl3Q6W5C0 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cxcl3Q6W5C0 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cxcl3Q6W5C0 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cxcl3Q6W5C0 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cxcl3Q6W5C0 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cxcl3Q6W5C0 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cxcl3Q6W5C0 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cxcl3Q6W5C0 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Cxcl3Q6W5C0 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Cxcl3Q6W5C0 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Cxcl3Q6W5C0 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cxcl3Q6W5C0 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cxcl3Q6W5C0 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cxcl3Q6W5C0 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cxcl3Q6W5C0 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cxcl3Q6W5C0 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms