Protein–RNA interactions for Protein: Q6TDU8

Casc1, Protein CASC1, mousemouse

Predictions only

Length 730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casc1Q6TDU8 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Casc1Q6TDU8 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Casc1Q6TDU8 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Casc1Q6TDU8 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Casc1Q6TDU8 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Casc1Q6TDU8 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Casc1Q6TDU8 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Casc1Q6TDU8 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Casc1Q6TDU8 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Casc1Q6TDU8 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Casc1Q6TDU8 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Casc1Q6TDU8 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Casc1Q6TDU8 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Casc1Q6TDU8 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Casc1Q6TDU8 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Casc1Q6TDU8 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Casc1Q6TDU8 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Casc1Q6TDU8 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Casc1Q6TDU8 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Casc1Q6TDU8 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Casc1Q6TDU8 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Casc1Q6TDU8 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Casc1Q6TDU8 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Casc1Q6TDU8 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Casc1Q6TDU8 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Casc1Q6TDU8 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Casc1Q6TDU8 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Casc1Q6TDU8 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Casc1Q6TDU8 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Casc1Q6TDU8 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Casc1Q6TDU8 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Casc1Q6TDU8 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Casc1Q6TDU8 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Casc1Q6TDU8 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Casc1Q6TDU8 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Casc1Q6TDU8 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Casc1Q6TDU8 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Casc1Q6TDU8 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Casc1Q6TDU8 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Casc1Q6TDU8 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Casc1Q6TDU8 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Casc1Q6TDU8 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Casc1Q6TDU8 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Casc1Q6TDU8 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Casc1Q6TDU8 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Casc1Q6TDU8 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Casc1Q6TDU8 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Casc1Q6TDU8 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Casc1Q6TDU8 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Casc1Q6TDU8 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Casc1Q6TDU8 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Casc1Q6TDU8 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Casc1Q6TDU8 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Casc1Q6TDU8 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Casc1Q6TDU8 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Casc1Q6TDU8 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Casc1Q6TDU8 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Casc1Q6TDU8 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Casc1Q6TDU8 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Casc1Q6TDU8 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Casc1Q6TDU8 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Casc1Q6TDU8 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Casc1Q6TDU8 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Casc1Q6TDU8 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Casc1Q6TDU8 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Casc1Q6TDU8 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Casc1Q6TDU8 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Casc1Q6TDU8 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Casc1Q6TDU8 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Casc1Q6TDU8 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Casc1Q6TDU8 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Casc1Q6TDU8 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Casc1Q6TDU8 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Casc1Q6TDU8 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Casc1Q6TDU8 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Casc1Q6TDU8 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Casc1Q6TDU8 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Casc1Q6TDU8 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Casc1Q6TDU8 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Casc1Q6TDU8 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Casc1Q6TDU8 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Casc1Q6TDU8 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Casc1Q6TDU8 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Casc1Q6TDU8 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Casc1Q6TDU8 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Casc1Q6TDU8 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Casc1Q6TDU8 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Casc1Q6TDU8 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Casc1Q6TDU8 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Casc1Q6TDU8 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Casc1Q6TDU8 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Casc1Q6TDU8 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Casc1Q6TDU8 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Casc1Q6TDU8 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Casc1Q6TDU8 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Casc1Q6TDU8 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Casc1Q6TDU8 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Casc1Q6TDU8 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Casc1Q6TDU8 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Casc1Q6TDU8 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms