Protein–RNA interactions for Protein: Q6T3U4

Npc1l1, Niemann-Pick C1-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npc1l1Q6T3U4 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Npc1l1Q6T3U4 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Npc1l1Q6T3U4 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Npc1l1Q6T3U4 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Npc1l1Q6T3U4 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Npc1l1Q6T3U4 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Npc1l1Q6T3U4 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Npc1l1Q6T3U4 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Npc1l1Q6T3U4 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Npc1l1Q6T3U4 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Npc1l1Q6T3U4 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Npc1l1Q6T3U4 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Npc1l1Q6T3U4 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Npc1l1Q6T3U4 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Npc1l1Q6T3U4 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Npc1l1Q6T3U4 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Npc1l1Q6T3U4 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Npc1l1Q6T3U4 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Npc1l1Q6T3U4 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Npc1l1Q6T3U4 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Npc1l1Q6T3U4 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Npc1l1Q6T3U4 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Npc1l1Q6T3U4 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Npc1l1Q6T3U4 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Npc1l1Q6T3U4 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Npc1l1Q6T3U4 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Npc1l1Q6T3U4 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Npc1l1Q6T3U4 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Npc1l1Q6T3U4 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Npc1l1Q6T3U4 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Npc1l1Q6T3U4 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Npc1l1Q6T3U4 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Npc1l1Q6T3U4 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Npc1l1Q6T3U4 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Npc1l1Q6T3U4 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Npc1l1Q6T3U4 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Npc1l1Q6T3U4 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Npc1l1Q6T3U4 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Npc1l1Q6T3U4 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Npc1l1Q6T3U4 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Npc1l1Q6T3U4 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Npc1l1Q6T3U4 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Npc1l1Q6T3U4 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Npc1l1Q6T3U4 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Npc1l1Q6T3U4 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Npc1l1Q6T3U4 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Npc1l1Q6T3U4 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Npc1l1Q6T3U4 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Npc1l1Q6T3U4 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Npc1l1Q6T3U4 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Npc1l1Q6T3U4 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Npc1l1Q6T3U4 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Npc1l1Q6T3U4 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Npc1l1Q6T3U4 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Npc1l1Q6T3U4 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Npc1l1Q6T3U4 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Npc1l1Q6T3U4 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Npc1l1Q6T3U4 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Npc1l1Q6T3U4 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Npc1l1Q6T3U4 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Npc1l1Q6T3U4 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Npc1l1Q6T3U4 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Npc1l1Q6T3U4 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Npc1l1Q6T3U4 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Npc1l1Q6T3U4 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Npc1l1Q6T3U4 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Npc1l1Q6T3U4 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Npc1l1Q6T3U4 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Npc1l1Q6T3U4 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Npc1l1Q6T3U4 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Npc1l1Q6T3U4 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Npc1l1Q6T3U4 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Npc1l1Q6T3U4 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Npc1l1Q6T3U4 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Npc1l1Q6T3U4 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Npc1l1Q6T3U4 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Npc1l1Q6T3U4 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Npc1l1Q6T3U4 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Npc1l1Q6T3U4 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Npc1l1Q6T3U4 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Npc1l1Q6T3U4 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Npc1l1Q6T3U4 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Npc1l1Q6T3U4 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Npc1l1Q6T3U4 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Npc1l1Q6T3U4 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Npc1l1Q6T3U4 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Npc1l1Q6T3U4 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Npc1l1Q6T3U4 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Npc1l1Q6T3U4 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Npc1l1Q6T3U4 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Npc1l1Q6T3U4 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Npc1l1Q6T3U4 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Npc1l1Q6T3U4 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Npc1l1Q6T3U4 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Npc1l1Q6T3U4 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Npc1l1Q6T3U4 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Npc1l1Q6T3U4 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Npc1l1Q6T3U4 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Npc1l1Q6T3U4 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Npc1l1Q6T3U4 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms