Protein–RNA interactions for Protein: Q6SJQ7

Cd300lf, CMRF35-like molecule 1, mousemouse

Predictions only

Length 337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd300lfQ6SJQ7 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Cd300lfQ6SJQ7 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Cd300lfQ6SJQ7 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cd300lfQ6SJQ7 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cd300lfQ6SJQ7 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cd300lfQ6SJQ7 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cd300lfQ6SJQ7 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cd300lfQ6SJQ7 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cd300lfQ6SJQ7 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cd300lfQ6SJQ7 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cd300lfQ6SJQ7 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Cd300lfQ6SJQ7 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cd300lfQ6SJQ7 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Cd300lfQ6SJQ7 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cd300lfQ6SJQ7 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cd300lfQ6SJQ7 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cd300lfQ6SJQ7 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cd300lfQ6SJQ7 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cd300lfQ6SJQ7 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cd300lfQ6SJQ7 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cd300lfQ6SJQ7 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cd300lfQ6SJQ7 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cd300lfQ6SJQ7 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cd300lfQ6SJQ7 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cd300lfQ6SJQ7 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cd300lfQ6SJQ7 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cd300lfQ6SJQ7 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cd300lfQ6SJQ7 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cd300lfQ6SJQ7 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Cd300lfQ6SJQ7 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cd300lfQ6SJQ7 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cd300lfQ6SJQ7 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cd300lfQ6SJQ7 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cd300lfQ6SJQ7 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cd300lfQ6SJQ7 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cd300lfQ6SJQ7 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cd300lfQ6SJQ7 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cd300lfQ6SJQ7 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cd300lfQ6SJQ7 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Cd300lfQ6SJQ7 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cd300lfQ6SJQ7 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cd300lfQ6SJQ7 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cd300lfQ6SJQ7 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Cd300lfQ6SJQ7 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cd300lfQ6SJQ7 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cd300lfQ6SJQ7 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cd300lfQ6SJQ7 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cd300lfQ6SJQ7 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cd300lfQ6SJQ7 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cd300lfQ6SJQ7 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cd300lfQ6SJQ7 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cd300lfQ6SJQ7 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cd300lfQ6SJQ7 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cd300lfQ6SJQ7 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Cd300lfQ6SJQ7 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cd300lfQ6SJQ7 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cd300lfQ6SJQ7 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Cd300lfQ6SJQ7 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cd300lfQ6SJQ7 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Cd300lfQ6SJQ7 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cd300lfQ6SJQ7 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cd300lfQ6SJQ7 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cd300lfQ6SJQ7 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cd300lfQ6SJQ7 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cd300lfQ6SJQ7 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cd300lfQ6SJQ7 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cd300lfQ6SJQ7 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cd300lfQ6SJQ7 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cd300lfQ6SJQ7 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cd300lfQ6SJQ7 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cd300lfQ6SJQ7 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cd300lfQ6SJQ7 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cd300lfQ6SJQ7 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cd300lfQ6SJQ7 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Cd300lfQ6SJQ7 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cd300lfQ6SJQ7 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cd300lfQ6SJQ7 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cd300lfQ6SJQ7 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cd300lfQ6SJQ7 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cd300lfQ6SJQ7 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cd300lfQ6SJQ7 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cd300lfQ6SJQ7 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cd300lfQ6SJQ7 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Cd300lfQ6SJQ7 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cd300lfQ6SJQ7 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cd300lfQ6SJQ7 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cd300lfQ6SJQ7 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cd300lfQ6SJQ7 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cd300lfQ6SJQ7 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cd300lfQ6SJQ7 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cd300lfQ6SJQ7 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cd300lfQ6SJQ7 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cd300lfQ6SJQ7 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cd300lfQ6SJQ7 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cd300lfQ6SJQ7 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cd300lfQ6SJQ7 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Cd300lfQ6SJQ7 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cd300lfQ6SJQ7 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cd300lfQ6SJQ7 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cd300lfQ6SJQ7 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.4 ms