Protein–RNA interactions for Protein: Q6QR59

Tcaf3, TRPM8 channel-associated factor 3, mousemouse

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Length 914 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcaf3Q6QR59 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tcaf3Q6QR59 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tcaf3Q6QR59 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tcaf3Q6QR59 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tcaf3Q6QR59 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Tcaf3Q6QR59 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tcaf3Q6QR59 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tcaf3Q6QR59 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tcaf3Q6QR59 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tcaf3Q6QR59 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tcaf3Q6QR59 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tcaf3Q6QR59 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Tcaf3Q6QR59 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tcaf3Q6QR59 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tcaf3Q6QR59 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tcaf3Q6QR59 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tcaf3Q6QR59 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tcaf3Q6QR59 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tcaf3Q6QR59 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tcaf3Q6QR59 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tcaf3Q6QR59 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tcaf3Q6QR59 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tcaf3Q6QR59 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tcaf3Q6QR59 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tcaf3Q6QR59 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Tcaf3Q6QR59 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tcaf3Q6QR59 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tcaf3Q6QR59 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tcaf3Q6QR59 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tcaf3Q6QR59 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tcaf3Q6QR59 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tcaf3Q6QR59 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tcaf3Q6QR59 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tcaf3Q6QR59 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tcaf3Q6QR59 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tcaf3Q6QR59 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tcaf3Q6QR59 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tcaf3Q6QR59 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tcaf3Q6QR59 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tcaf3Q6QR59 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tcaf3Q6QR59 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tcaf3Q6QR59 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tcaf3Q6QR59 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tcaf3Q6QR59 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tcaf3Q6QR59 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Tcaf3Q6QR59 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tcaf3Q6QR59 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tcaf3Q6QR59 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tcaf3Q6QR59 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tcaf3Q6QR59 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tcaf3Q6QR59 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tcaf3Q6QR59 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tcaf3Q6QR59 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tcaf3Q6QR59 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tcaf3Q6QR59 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tcaf3Q6QR59 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tcaf3Q6QR59 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tcaf3Q6QR59 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tcaf3Q6QR59 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tcaf3Q6QR59 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tcaf3Q6QR59 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tcaf3Q6QR59 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tcaf3Q6QR59 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
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Tcaf3Q6QR59 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
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Tcaf3Q6QR59 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tcaf3Q6QR59 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
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Tcaf3Q6QR59 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tcaf3Q6QR59 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tcaf3Q6QR59 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tcaf3Q6QR59 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
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Tcaf3Q6QR59 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tcaf3Q6QR59 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tcaf3Q6QR59 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tcaf3Q6QR59 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tcaf3Q6QR59 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tcaf3Q6QR59 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tcaf3Q6QR59 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tcaf3Q6QR59 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tcaf3Q6QR59 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tcaf3Q6QR59 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tcaf3Q6QR59 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Tcaf3Q6QR59 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tcaf3Q6QR59 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tcaf3Q6QR59 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tcaf3Q6QR59 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tcaf3Q6QR59 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tcaf3Q6QR59 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Tcaf3Q6QR59 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tcaf3Q6QR59 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tcaf3Q6QR59 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tcaf3Q6QR59 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tcaf3Q6QR59 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tcaf3Q6QR59 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Tcaf3Q6QR59 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tcaf3Q6QR59 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tcaf3Q6QR59 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
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