Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q473

Clca4a, Calcium-activated chloride channel regulator 4A, mousemouse

Predictions only

Length 924 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca4aQ6Q473 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Clca4aQ6Q473 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Clca4aQ6Q473 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Clca4aQ6Q473 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Clca4aQ6Q473 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Clca4aQ6Q473 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Clca4aQ6Q473 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Clca4aQ6Q473 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Clca4aQ6Q473 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Clca4aQ6Q473 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Clca4aQ6Q473 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Clca4aQ6Q473 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Clca4aQ6Q473 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Clca4aQ6Q473 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Clca4aQ6Q473 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Clca4aQ6Q473 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Clca4aQ6Q473 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Clca4aQ6Q473 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Clca4aQ6Q473 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Clca4aQ6Q473 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Clca4aQ6Q473 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Clca4aQ6Q473 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Clca4aQ6Q473 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Clca4aQ6Q473 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Clca4aQ6Q473 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Clca4aQ6Q473 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Clca4aQ6Q473 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Clca4aQ6Q473 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Clca4aQ6Q473 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Clca4aQ6Q473 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Clca4aQ6Q473 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Clca4aQ6Q473 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Clca4aQ6Q473 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Clca4aQ6Q473 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Clca4aQ6Q473 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Clca4aQ6Q473 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Clca4aQ6Q473 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Clca4aQ6Q473 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Clca4aQ6Q473 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Clca4aQ6Q473 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Clca4aQ6Q473 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Clca4aQ6Q473 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Clca4aQ6Q473 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Clca4aQ6Q473 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Clca4aQ6Q473 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Clca4aQ6Q473 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Clca4aQ6Q473 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Clca4aQ6Q473 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Clca4aQ6Q473 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Clca4aQ6Q473 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Clca4aQ6Q473 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Clca4aQ6Q473 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Clca4aQ6Q473 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Clca4aQ6Q473 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Clca4aQ6Q473 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Clca4aQ6Q473 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Clca4aQ6Q473 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Clca4aQ6Q473 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Clca4aQ6Q473 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Clca4aQ6Q473 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Clca4aQ6Q473 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Clca4aQ6Q473 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Clca4aQ6Q473 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Clca4aQ6Q473 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Clca4aQ6Q473 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Clca4aQ6Q473 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Clca4aQ6Q473 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Clca4aQ6Q473 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Clca4aQ6Q473 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Clca4aQ6Q473 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Clca4aQ6Q473 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Clca4aQ6Q473 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Clca4aQ6Q473 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Clca4aQ6Q473 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Clca4aQ6Q473 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Clca4aQ6Q473 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Clca4aQ6Q473 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Clca4aQ6Q473 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Clca4aQ6Q473 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Clca4aQ6Q473 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Clca4aQ6Q473 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Clca4aQ6Q473 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Clca4aQ6Q473 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Clca4aQ6Q473 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Clca4aQ6Q473 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Clca4aQ6Q473 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Clca4aQ6Q473 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Clca4aQ6Q473 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Clca4aQ6Q473 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Clca4aQ6Q473 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Clca4aQ6Q473 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Clca4aQ6Q473 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Clca4aQ6Q473 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Clca4aQ6Q473 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Clca4aQ6Q473 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Clca4aQ6Q473 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Clca4aQ6Q473 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Clca4aQ6Q473 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Clca4aQ6Q473 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Clca4aQ6Q473 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms