Protein–RNA interactions for Protein: Q6PE55

Pdgfrl, Platelet-derived growth factor receptor-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfrlQ6PE55 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PdgfrlQ6PE55 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PdgfrlQ6PE55 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PdgfrlQ6PE55 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PdgfrlQ6PE55 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PdgfrlQ6PE55 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PdgfrlQ6PE55 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PdgfrlQ6PE55 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PdgfrlQ6PE55 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PdgfrlQ6PE55 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PdgfrlQ6PE55 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PdgfrlQ6PE55 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PdgfrlQ6PE55 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PdgfrlQ6PE55 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
PdgfrlQ6PE55 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PdgfrlQ6PE55 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PdgfrlQ6PE55 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PdgfrlQ6PE55 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PdgfrlQ6PE55 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PdgfrlQ6PE55 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PdgfrlQ6PE55 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PdgfrlQ6PE55 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PdgfrlQ6PE55 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PdgfrlQ6PE55 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
PdgfrlQ6PE55 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PdgfrlQ6PE55 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PdgfrlQ6PE55 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
PdgfrlQ6PE55 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PdgfrlQ6PE55 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PdgfrlQ6PE55 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PdgfrlQ6PE55 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PdgfrlQ6PE55 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PdgfrlQ6PE55 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PdgfrlQ6PE55 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
PdgfrlQ6PE55 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PdgfrlQ6PE55 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PdgfrlQ6PE55 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PdgfrlQ6PE55 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PdgfrlQ6PE55 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PdgfrlQ6PE55 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PdgfrlQ6PE55 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PdgfrlQ6PE55 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PdgfrlQ6PE55 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PdgfrlQ6PE55 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PdgfrlQ6PE55 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PdgfrlQ6PE55 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PdgfrlQ6PE55 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PdgfrlQ6PE55 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PdgfrlQ6PE55 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PdgfrlQ6PE55 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PdgfrlQ6PE55 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PdgfrlQ6PE55 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PdgfrlQ6PE55 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PdgfrlQ6PE55 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PdgfrlQ6PE55 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PdgfrlQ6PE55 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PdgfrlQ6PE55 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PdgfrlQ6PE55 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PdgfrlQ6PE55 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PdgfrlQ6PE55 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PdgfrlQ6PE55 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PdgfrlQ6PE55 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PdgfrlQ6PE55 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PdgfrlQ6PE55 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PdgfrlQ6PE55 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PdgfrlQ6PE55 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PdgfrlQ6PE55 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PdgfrlQ6PE55 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PdgfrlQ6PE55 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PdgfrlQ6PE55 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PdgfrlQ6PE55 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PdgfrlQ6PE55 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PdgfrlQ6PE55 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PdgfrlQ6PE55 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PdgfrlQ6PE55 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PdgfrlQ6PE55 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PdgfrlQ6PE55 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PdgfrlQ6PE55 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PdgfrlQ6PE55 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
PdgfrlQ6PE55 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PdgfrlQ6PE55 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PdgfrlQ6PE55 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PdgfrlQ6PE55 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PdgfrlQ6PE55 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PdgfrlQ6PE55 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
PdgfrlQ6PE55 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PdgfrlQ6PE55 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PdgfrlQ6PE55 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PdgfrlQ6PE55 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PdgfrlQ6PE55 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PdgfrlQ6PE55 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PdgfrlQ6PE55 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PdgfrlQ6PE55 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PdgfrlQ6PE55 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PdgfrlQ6PE55 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PdgfrlQ6PE55 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PdgfrlQ6PE55 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PdgfrlQ6PE55 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PdgfrlQ6PE55 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PdgfrlQ6PE55 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.2 ms