Protein–RNA interactions for Protein: Q6PE01

Snrnp40, U5 small nuclear ribonucleoprotein 40 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrnp40Q6PE01 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snrnp40Q6PE01 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snrnp40Q6PE01 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snrnp40Q6PE01 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snrnp40Q6PE01 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snrnp40Q6PE01 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snrnp40Q6PE01 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snrnp40Q6PE01 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snrnp40Q6PE01 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snrnp40Q6PE01 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snrnp40Q6PE01 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snrnp40Q6PE01 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snrnp40Q6PE01 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snrnp40Q6PE01 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snrnp40Q6PE01 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snrnp40Q6PE01 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snrnp40Q6PE01 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snrnp40Q6PE01 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snrnp40Q6PE01 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snrnp40Q6PE01 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snrnp40Q6PE01 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snrnp40Q6PE01 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snrnp40Q6PE01 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snrnp40Q6PE01 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Snrnp40Q6PE01 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snrnp40Q6PE01 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snrnp40Q6PE01 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snrnp40Q6PE01 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snrnp40Q6PE01 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snrnp40Q6PE01 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snrnp40Q6PE01 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snrnp40Q6PE01 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snrnp40Q6PE01 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snrnp40Q6PE01 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snrnp40Q6PE01 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snrnp40Q6PE01 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snrnp40Q6PE01 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snrnp40Q6PE01 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snrnp40Q6PE01 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snrnp40Q6PE01 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Snrnp40Q6PE01 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snrnp40Q6PE01 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snrnp40Q6PE01 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Snrnp40Q6PE01 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snrnp40Q6PE01 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snrnp40Q6PE01 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snrnp40Q6PE01 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snrnp40Q6PE01 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snrnp40Q6PE01 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snrnp40Q6PE01 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snrnp40Q6PE01 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Snrnp40Q6PE01 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snrnp40Q6PE01 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snrnp40Q6PE01 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snrnp40Q6PE01 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snrnp40Q6PE01 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snrnp40Q6PE01 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snrnp40Q6PE01 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snrnp40Q6PE01 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snrnp40Q6PE01 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snrnp40Q6PE01 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Snrnp40Q6PE01 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snrnp40Q6PE01 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snrnp40Q6PE01 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snrnp40Q6PE01 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snrnp40Q6PE01 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snrnp40Q6PE01 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snrnp40Q6PE01 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snrnp40Q6PE01 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snrnp40Q6PE01 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snrnp40Q6PE01 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snrnp40Q6PE01 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snrnp40Q6PE01 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snrnp40Q6PE01 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snrnp40Q6PE01 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snrnp40Q6PE01 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snrnp40Q6PE01 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snrnp40Q6PE01 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snrnp40Q6PE01 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snrnp40Q6PE01 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snrnp40Q6PE01 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snrnp40Q6PE01 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Snrnp40Q6PE01 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snrnp40Q6PE01 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snrnp40Q6PE01 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snrnp40Q6PE01 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snrnp40Q6PE01 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snrnp40Q6PE01 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snrnp40Q6PE01 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snrnp40Q6PE01 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snrnp40Q6PE01 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snrnp40Q6PE01 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Snrnp40Q6PE01 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snrnp40Q6PE01 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snrnp40Q6PE01 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snrnp40Q6PE01 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snrnp40Q6PE01 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snrnp40Q6PE01 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snrnp40Q6PE01 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snrnp40Q6PE01 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms