Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9L4

Usp49, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 49, mousemouse

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp49Q6P9L4 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Usp49Q6P9L4 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Usp49Q6P9L4 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Usp49Q6P9L4 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Usp49Q6P9L4 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Usp49Q6P9L4 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Usp49Q6P9L4 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Usp49Q6P9L4 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Usp49Q6P9L4 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Usp49Q6P9L4 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Usp49Q6P9L4 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Usp49Q6P9L4 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Usp49Q6P9L4 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Usp49Q6P9L4 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Usp49Q6P9L4 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Usp49Q6P9L4 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Usp49Q6P9L4 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Usp49Q6P9L4 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Usp49Q6P9L4 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Usp49Q6P9L4 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Usp49Q6P9L4 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Usp49Q6P9L4 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Usp49Q6P9L4 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Usp49Q6P9L4 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Usp49Q6P9L4 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Usp49Q6P9L4 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Usp49Q6P9L4 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Usp49Q6P9L4 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Usp49Q6P9L4 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Usp49Q6P9L4 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Usp49Q6P9L4 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Usp49Q6P9L4 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Usp49Q6P9L4 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Usp49Q6P9L4 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Usp49Q6P9L4 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Usp49Q6P9L4 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Usp49Q6P9L4 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Usp49Q6P9L4 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Usp49Q6P9L4 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Usp49Q6P9L4 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Usp49Q6P9L4 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Usp49Q6P9L4 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Usp49Q6P9L4 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Usp49Q6P9L4 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Usp49Q6P9L4 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Usp49Q6P9L4 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Usp49Q6P9L4 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Usp49Q6P9L4 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Usp49Q6P9L4 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Usp49Q6P9L4 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Usp49Q6P9L4 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Usp49Q6P9L4 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Usp49Q6P9L4 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Usp49Q6P9L4 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Usp49Q6P9L4 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Usp49Q6P9L4 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Usp49Q6P9L4 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Usp49Q6P9L4 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Usp49Q6P9L4 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Usp49Q6P9L4 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Usp49Q6P9L4 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Usp49Q6P9L4 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Usp49Q6P9L4 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Usp49Q6P9L4 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Usp49Q6P9L4 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Usp49Q6P9L4 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Usp49Q6P9L4 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Usp49Q6P9L4 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Usp49Q6P9L4 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Usp49Q6P9L4 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Usp49Q6P9L4 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Usp49Q6P9L4 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Usp49Q6P9L4 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Usp49Q6P9L4 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Usp49Q6P9L4 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Usp49Q6P9L4 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Usp49Q6P9L4 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Usp49Q6P9L4 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Usp49Q6P9L4 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Usp49Q6P9L4 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Usp49Q6P9L4 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Usp49Q6P9L4 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Usp49Q6P9L4 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Usp49Q6P9L4 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Usp49Q6P9L4 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Usp49Q6P9L4 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Usp49Q6P9L4 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Usp49Q6P9L4 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Usp49Q6P9L4 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Usp49Q6P9L4 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Usp49Q6P9L4 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Usp49Q6P9L4 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Usp49Q6P9L4 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Usp49Q6P9L4 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Usp49Q6P9L4 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Usp49Q6P9L4 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Usp49Q6P9L4 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Usp49Q6P9L4 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Usp49Q6P9L4 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Usp49Q6P9L4 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms