Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3A4

Vsig8, V-set and immunoglobulin domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsig8Q6P3A4 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vsig8Q6P3A4 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vsig8Q6P3A4 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Vsig8Q6P3A4 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vsig8Q6P3A4 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vsig8Q6P3A4 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vsig8Q6P3A4 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vsig8Q6P3A4 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vsig8Q6P3A4 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vsig8Q6P3A4 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vsig8Q6P3A4 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vsig8Q6P3A4 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vsig8Q6P3A4 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vsig8Q6P3A4 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vsig8Q6P3A4 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vsig8Q6P3A4 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vsig8Q6P3A4 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vsig8Q6P3A4 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vsig8Q6P3A4 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vsig8Q6P3A4 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vsig8Q6P3A4 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vsig8Q6P3A4 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vsig8Q6P3A4 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Vsig8Q6P3A4 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vsig8Q6P3A4 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vsig8Q6P3A4 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vsig8Q6P3A4 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vsig8Q6P3A4 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vsig8Q6P3A4 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vsig8Q6P3A4 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Vsig8Q6P3A4 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vsig8Q6P3A4 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vsig8Q6P3A4 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vsig8Q6P3A4 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vsig8Q6P3A4 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vsig8Q6P3A4 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vsig8Q6P3A4 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vsig8Q6P3A4 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vsig8Q6P3A4 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vsig8Q6P3A4 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vsig8Q6P3A4 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vsig8Q6P3A4 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vsig8Q6P3A4 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vsig8Q6P3A4 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vsig8Q6P3A4 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vsig8Q6P3A4 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vsig8Q6P3A4 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vsig8Q6P3A4 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Vsig8Q6P3A4 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Vsig8Q6P3A4 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vsig8Q6P3A4 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Vsig8Q6P3A4 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Vsig8Q6P3A4 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vsig8Q6P3A4 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vsig8Q6P3A4 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vsig8Q6P3A4 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vsig8Q6P3A4 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vsig8Q6P3A4 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vsig8Q6P3A4 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vsig8Q6P3A4 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vsig8Q6P3A4 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vsig8Q6P3A4 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vsig8Q6P3A4 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vsig8Q6P3A4 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vsig8Q6P3A4 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vsig8Q6P3A4 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vsig8Q6P3A4 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vsig8Q6P3A4 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vsig8Q6P3A4 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vsig8Q6P3A4 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vsig8Q6P3A4 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vsig8Q6P3A4 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vsig8Q6P3A4 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vsig8Q6P3A4 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vsig8Q6P3A4 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vsig8Q6P3A4 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Vsig8Q6P3A4 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vsig8Q6P3A4 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vsig8Q6P3A4 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vsig8Q6P3A4 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vsig8Q6P3A4 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vsig8Q6P3A4 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vsig8Q6P3A4 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vsig8Q6P3A4 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vsig8Q6P3A4 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vsig8Q6P3A4 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vsig8Q6P3A4 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vsig8Q6P3A4 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vsig8Q6P3A4 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vsig8Q6P3A4 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vsig8Q6P3A4 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vsig8Q6P3A4 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vsig8Q6P3A4 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vsig8Q6P3A4 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vsig8Q6P3A4 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vsig8Q6P3A4 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vsig8Q6P3A4 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vsig8Q6P3A4 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vsig8Q6P3A4 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vsig8Q6P3A4 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms