Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3A4

Vsig8, V-set and immunoglobulin domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsig8Q6P3A4 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vsig8Q6P3A4 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vsig8Q6P3A4 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Vsig8Q6P3A4 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vsig8Q6P3A4 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vsig8Q6P3A4 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vsig8Q6P3A4 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vsig8Q6P3A4 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vsig8Q6P3A4 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vsig8Q6P3A4 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vsig8Q6P3A4 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vsig8Q6P3A4 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vsig8Q6P3A4 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vsig8Q6P3A4 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vsig8Q6P3A4 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vsig8Q6P3A4 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vsig8Q6P3A4 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vsig8Q6P3A4 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vsig8Q6P3A4 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vsig8Q6P3A4 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vsig8Q6P3A4 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vsig8Q6P3A4 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vsig8Q6P3A4 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Vsig8Q6P3A4 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vsig8Q6P3A4 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vsig8Q6P3A4 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vsig8Q6P3A4 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vsig8Q6P3A4 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vsig8Q6P3A4 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vsig8Q6P3A4 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Vsig8Q6P3A4 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vsig8Q6P3A4 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vsig8Q6P3A4 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vsig8Q6P3A4 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vsig8Q6P3A4 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vsig8Q6P3A4 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vsig8Q6P3A4 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vsig8Q6P3A4 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vsig8Q6P3A4 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vsig8Q6P3A4 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vsig8Q6P3A4 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vsig8Q6P3A4 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vsig8Q6P3A4 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vsig8Q6P3A4 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vsig8Q6P3A4 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vsig8Q6P3A4 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vsig8Q6P3A4 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vsig8Q6P3A4 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Vsig8Q6P3A4 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Vsig8Q6P3A4 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vsig8Q6P3A4 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Vsig8Q6P3A4 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Vsig8Q6P3A4 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vsig8Q6P3A4 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vsig8Q6P3A4 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vsig8Q6P3A4 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vsig8Q6P3A4 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vsig8Q6P3A4 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vsig8Q6P3A4 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vsig8Q6P3A4 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vsig8Q6P3A4 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vsig8Q6P3A4 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vsig8Q6P3A4 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vsig8Q6P3A4 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vsig8Q6P3A4 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vsig8Q6P3A4 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vsig8Q6P3A4 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vsig8Q6P3A4 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vsig8Q6P3A4 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vsig8Q6P3A4 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vsig8Q6P3A4 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vsig8Q6P3A4 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vsig8Q6P3A4 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vsig8Q6P3A4 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vsig8Q6P3A4 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vsig8Q6P3A4 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Vsig8Q6P3A4 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vsig8Q6P3A4 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vsig8Q6P3A4 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vsig8Q6P3A4 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vsig8Q6P3A4 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vsig8Q6P3A4 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vsig8Q6P3A4 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vsig8Q6P3A4 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vsig8Q6P3A4 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vsig8Q6P3A4 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vsig8Q6P3A4 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vsig8Q6P3A4 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vsig8Q6P3A4 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vsig8Q6P3A4 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vsig8Q6P3A4 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vsig8Q6P3A4 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vsig8Q6P3A4 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vsig8Q6P3A4 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vsig8Q6P3A4 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vsig8Q6P3A4 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vsig8Q6P3A4 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vsig8Q6P3A4 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vsig8Q6P3A4 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vsig8Q6P3A4 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 191.5 ms