Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1D7

Slx4, Structure-specific endonuclease subunit SLX4, mousemouse

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slx4Q6P1D7 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
Slx4Q6P1D7 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Slx4Q6P1D7 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Slx4Q6P1D7 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC32.49■■■□□ 2.79
Slx4Q6P1D7 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Slx4Q6P1D7 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Slx4Q6P1D7 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC32.48■■■□□ 2.79
Slx4Q6P1D7 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Slx4Q6P1D7 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Slx4Q6P1D7 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
Slx4Q6P1D7 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Slx4Q6P1D7 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
Slx4Q6P1D7 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Slx4Q6P1D7 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Slx4Q6P1D7 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
Slx4Q6P1D7 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Slx4Q6P1D7 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.79
Slx4Q6P1D7 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
Slx4Q6P1D7 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
Slx4Q6P1D7 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
Slx4Q6P1D7 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Slx4Q6P1D7 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Slx4Q6P1D7 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
Slx4Q6P1D7 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Slx4Q6P1D7 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
Slx4Q6P1D7 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Slx4Q6P1D7 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Slx4Q6P1D7 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
Slx4Q6P1D7 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Slx4Q6P1D7 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
Slx4Q6P1D7 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Slx4Q6P1D7 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
Slx4Q6P1D7 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Slx4Q6P1D7 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
Slx4Q6P1D7 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC32.41■■■□□ 2.78
Slx4Q6P1D7 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Slx4Q6P1D7 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
Slx4Q6P1D7 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
Slx4Q6P1D7 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC32.41■■■□□ 2.78
Slx4Q6P1D7 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
Slx4Q6P1D7 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Slx4Q6P1D7 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
Slx4Q6P1D7 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Slx4Q6P1D7 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Slx4Q6P1D7 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Slx4Q6P1D7 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Slx4Q6P1D7 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Slx4Q6P1D7 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Slx4Q6P1D7 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC32.4■■■□□ 2.78
Slx4Q6P1D7 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Slx4Q6P1D7 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Slx4Q6P1D7 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Slx4Q6P1D7 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Slx4Q6P1D7 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Slx4Q6P1D7 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
Slx4Q6P1D7 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.77
Slx4Q6P1D7 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Slx4Q6P1D7 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC32.38■■■□□ 2.77
Slx4Q6P1D7 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Slx4Q6P1D7 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Slx4Q6P1D7 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Slx4Q6P1D7 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC32.37■■■□□ 2.77
Slx4Q6P1D7 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Slx4Q6P1D7 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
Slx4Q6P1D7 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC32.36■■■□□ 2.77
Slx4Q6P1D7 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Slx4Q6P1D7 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC32.36■■■□□ 2.77
Slx4Q6P1D7 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Slx4Q6P1D7 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
Slx4Q6P1D7 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Slx4Q6P1D7 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Slx4Q6P1D7 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC32.35■■■□□ 2.77
Slx4Q6P1D7 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
Slx4Q6P1D7 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Slx4Q6P1D7 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC32.34■■■□□ 2.77
Slx4Q6P1D7 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC32.34■■■□□ 2.77
Slx4Q6P1D7 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
Slx4Q6P1D7 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.77
Slx4Q6P1D7 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC32.32■■■□□ 2.76
Slx4Q6P1D7 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Slx4Q6P1D7 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
Slx4Q6P1D7 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
Slx4Q6P1D7 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Slx4Q6P1D7 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Slx4Q6P1D7 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
Slx4Q6P1D7 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC32.3■■■□□ 2.76
Slx4Q6P1D7 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Slx4Q6P1D7 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Slx4Q6P1D7 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC32.29■■■□□ 2.76
Slx4Q6P1D7 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC32.29■■■□□ 2.76
Slx4Q6P1D7 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Slx4Q6P1D7 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Slx4Q6P1D7 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC32.28■■■□□ 2.76
Slx4Q6P1D7 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Slx4Q6P1D7 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Slx4Q6P1D7 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC32.28■■■□□ 2.76
Slx4Q6P1D7 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Slx4Q6P1D7 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Slx4Q6P1D7 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
Slx4Q6P1D7 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms