Protein–RNA interactions for Protein: Q6GV12

Kdsr, 3-ketodihydrosphingosine reductase, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KdsrQ6GV12 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KdsrQ6GV12 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
KdsrQ6GV12 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KdsrQ6GV12 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KdsrQ6GV12 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KdsrQ6GV12 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KdsrQ6GV12 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KdsrQ6GV12 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KdsrQ6GV12 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KdsrQ6GV12 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KdsrQ6GV12 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KdsrQ6GV12 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KdsrQ6GV12 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KdsrQ6GV12 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KdsrQ6GV12 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KdsrQ6GV12 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KdsrQ6GV12 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KdsrQ6GV12 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
KdsrQ6GV12 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
KdsrQ6GV12 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
KdsrQ6GV12 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
KdsrQ6GV12 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
KdsrQ6GV12 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
KdsrQ6GV12 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
KdsrQ6GV12 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KdsrQ6GV12 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KdsrQ6GV12 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KdsrQ6GV12 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
KdsrQ6GV12 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
KdsrQ6GV12 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KdsrQ6GV12 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KdsrQ6GV12 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KdsrQ6GV12 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KdsrQ6GV12 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KdsrQ6GV12 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
KdsrQ6GV12 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KdsrQ6GV12 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
KdsrQ6GV12 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
KdsrQ6GV12 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
KdsrQ6GV12 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KdsrQ6GV12 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KdsrQ6GV12 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
KdsrQ6GV12 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KdsrQ6GV12 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KdsrQ6GV12 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KdsrQ6GV12 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KdsrQ6GV12 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KdsrQ6GV12 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
KdsrQ6GV12 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KdsrQ6GV12 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
KdsrQ6GV12 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
KdsrQ6GV12 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KdsrQ6GV12 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
KdsrQ6GV12 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KdsrQ6GV12 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KdsrQ6GV12 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
KdsrQ6GV12 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KdsrQ6GV12 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
KdsrQ6GV12 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KdsrQ6GV12 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
KdsrQ6GV12 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
KdsrQ6GV12 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KdsrQ6GV12 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KdsrQ6GV12 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
KdsrQ6GV12 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
KdsrQ6GV12 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
KdsrQ6GV12 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
KdsrQ6GV12 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
KdsrQ6GV12 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
KdsrQ6GV12 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
KdsrQ6GV12 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
KdsrQ6GV12 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
KdsrQ6GV12 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
KdsrQ6GV12 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
KdsrQ6GV12 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
KdsrQ6GV12 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
KdsrQ6GV12 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
KdsrQ6GV12 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
KdsrQ6GV12 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
KdsrQ6GV12 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
KdsrQ6GV12 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
KdsrQ6GV12 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
KdsrQ6GV12 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KdsrQ6GV12 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KdsrQ6GV12 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KdsrQ6GV12 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
KdsrQ6GV12 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KdsrQ6GV12 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
KdsrQ6GV12 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KdsrQ6GV12 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KdsrQ6GV12 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KdsrQ6GV12 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KdsrQ6GV12 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
KdsrQ6GV12 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KdsrQ6GV12 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
KdsrQ6GV12 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KdsrQ6GV12 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KdsrQ6GV12 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KdsrQ6GV12 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KdsrQ6GV12 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms