Protein–RNA interactions for Protein: Q6GQU0

UPF0524 protein C3orf70 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6GQU0 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Q6GQU0 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Q6GQU0 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Q6GQU0 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Q6GQU0 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Q6GQU0 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Q6GQU0 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Q6GQU0 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Q6GQU0 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Q6GQU0 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Q6GQU0 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Q6GQU0 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Q6GQU0 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Q6GQU0 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Q6GQU0 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Q6GQU0 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Q6GQU0 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Q6GQU0 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Q6GQU0 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Q6GQU0 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Q6GQU0 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Q6GQU0 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Q6GQU0 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Q6GQU0 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Q6GQU0 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Q6GQU0 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Q6GQU0 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Q6GQU0 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Q6GQU0 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Q6GQU0 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Q6GQU0 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Q6GQU0 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Q6GQU0 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Q6GQU0 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Q6GQU0 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Q6GQU0 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Q6GQU0 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Q6GQU0 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Q6GQU0 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Q6GQU0 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Q6GQU0 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Q6GQU0 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Q6GQU0 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Q6GQU0 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Q6GQU0 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Q6GQU0 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Q6GQU0 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Q6GQU0 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Q6GQU0 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Q6GQU0 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Q6GQU0 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Q6GQU0 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Q6GQU0 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Q6GQU0 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Q6GQU0 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Q6GQU0 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Q6GQU0 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Q6GQU0 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Q6GQU0 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Q6GQU0 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Q6GQU0 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Q6GQU0 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Q6GQU0 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Q6GQU0 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Q6GQU0 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Q6GQU0 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Q6GQU0 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Q6GQU0 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Q6GQU0 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Q6GQU0 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Q6GQU0 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Q6GQU0 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Q6GQU0 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Q6GQU0 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Q6GQU0 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Q6GQU0 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Q6GQU0 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Q6GQU0 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Q6GQU0 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Q6GQU0 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Q6GQU0 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Q6GQU0 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Q6GQU0 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Q6GQU0 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Q6GQU0 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Q6GQU0 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Q6GQU0 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Q6GQU0 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Q6GQU0 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Q6GQU0 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Q6GQU0 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Q6GQU0 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Q6GQU0 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Q6GQU0 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Q6GQU0 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Q6GQU0 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Q6GQU0 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Q6GQU0 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Q6GQU0 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Q6GQU0 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms