Protein–RNA interactions for Protein: Q6GQT9

Nomo1, Nodal modulator 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nomo1Q6GQT9 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Nomo1Q6GQT9 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Nomo1Q6GQT9 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Nomo1Q6GQT9 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Nomo1Q6GQT9 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Nomo1Q6GQT9 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Nomo1Q6GQT9 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Nomo1Q6GQT9 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Nomo1Q6GQT9 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Nomo1Q6GQT9 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Nomo1Q6GQT9 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Nomo1Q6GQT9 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Nomo1Q6GQT9 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Nomo1Q6GQT9 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Nomo1Q6GQT9 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Nomo1Q6GQT9 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Nomo1Q6GQT9 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Nomo1Q6GQT9 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Nomo1Q6GQT9 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Nomo1Q6GQT9 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Nomo1Q6GQT9 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Nomo1Q6GQT9 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Nomo1Q6GQT9 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Nomo1Q6GQT9 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Nomo1Q6GQT9 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Nomo1Q6GQT9 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Nomo1Q6GQT9 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Nomo1Q6GQT9 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Nomo1Q6GQT9 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Nomo1Q6GQT9 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Nomo1Q6GQT9 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Nomo1Q6GQT9 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Nomo1Q6GQT9 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Nomo1Q6GQT9 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Nomo1Q6GQT9 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Nomo1Q6GQT9 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Nomo1Q6GQT9 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Nomo1Q6GQT9 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Nomo1Q6GQT9 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Nomo1Q6GQT9 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Nomo1Q6GQT9 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Nomo1Q6GQT9 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Nomo1Q6GQT9 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Nomo1Q6GQT9 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nomo1Q6GQT9 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nomo1Q6GQT9 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nomo1Q6GQT9 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nomo1Q6GQT9 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nomo1Q6GQT9 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nomo1Q6GQT9 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nomo1Q6GQT9 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nomo1Q6GQT9 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nomo1Q6GQT9 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Nomo1Q6GQT9 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nomo1Q6GQT9 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nomo1Q6GQT9 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nomo1Q6GQT9 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nomo1Q6GQT9 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nomo1Q6GQT9 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nomo1Q6GQT9 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nomo1Q6GQT9 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nomo1Q6GQT9 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nomo1Q6GQT9 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nomo1Q6GQT9 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nomo1Q6GQT9 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Nomo1Q6GQT9 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nomo1Q6GQT9 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nomo1Q6GQT9 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Nomo1Q6GQT9 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Nomo1Q6GQT9 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nomo1Q6GQT9 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nomo1Q6GQT9 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nomo1Q6GQT9 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nomo1Q6GQT9 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Nomo1Q6GQT9 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Nomo1Q6GQT9 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Nomo1Q6GQT9 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Nomo1Q6GQT9 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Nomo1Q6GQT9 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Nomo1Q6GQT9 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nomo1Q6GQT9 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nomo1Q6GQT9 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nomo1Q6GQT9 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nomo1Q6GQT9 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nomo1Q6GQT9 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nomo1Q6GQT9 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nomo1Q6GQT9 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nomo1Q6GQT9 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nomo1Q6GQT9 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nomo1Q6GQT9 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nomo1Q6GQT9 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nomo1Q6GQT9 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Nomo1Q6GQT9 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nomo1Q6GQT9 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nomo1Q6GQT9 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nomo1Q6GQT9 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nomo1Q6GQT9 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nomo1Q6GQT9 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nomo1Q6GQT9 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nomo1Q6GQT9 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms