Protein–RNA interactions for Protein: Q6EDY6

Carmil1, F-actin-uncapping protein LRRC16A, mousemouse

Predictions only

Length 1,374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Carmil1Q6EDY6 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC32.63■■■□□ 2.81
Carmil1Q6EDY6 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
Carmil1Q6EDY6 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Carmil1Q6EDY6 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC32.62■■■□□ 2.81
Carmil1Q6EDY6 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC32.62■■■□□ 2.81
Carmil1Q6EDY6 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
Carmil1Q6EDY6 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Carmil1Q6EDY6 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Carmil1Q6EDY6 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Carmil1Q6EDY6 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Carmil1Q6EDY6 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC32.6■■■□□ 2.81
Carmil1Q6EDY6 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Carmil1Q6EDY6 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Carmil1Q6EDY6 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Carmil1Q6EDY6 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
Carmil1Q6EDY6 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Carmil1Q6EDY6 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Carmil1Q6EDY6 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC32.58■■■□□ 2.81
Carmil1Q6EDY6 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Carmil1Q6EDY6 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC32.58■■■□□ 2.81
Carmil1Q6EDY6 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC32.58■■■□□ 2.81
Carmil1Q6EDY6 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Carmil1Q6EDY6 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.81
Carmil1Q6EDY6 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
Carmil1Q6EDY6 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Carmil1Q6EDY6 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
Carmil1Q6EDY6 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Carmil1Q6EDY6 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Carmil1Q6EDY6 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Carmil1Q6EDY6 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Carmil1Q6EDY6 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
Carmil1Q6EDY6 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
Carmil1Q6EDY6 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
Carmil1Q6EDY6 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Carmil1Q6EDY6 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Carmil1Q6EDY6 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC32.55■■■□□ 2.8
Carmil1Q6EDY6 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Carmil1Q6EDY6 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Carmil1Q6EDY6 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Carmil1Q6EDY6 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.55■■■□□ 2.8
Carmil1Q6EDY6 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Carmil1Q6EDY6 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC32.55■■■□□ 2.8
Carmil1Q6EDY6 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC32.55■■■□□ 2.8
Carmil1Q6EDY6 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Carmil1Q6EDY6 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC32.54■■■□□ 2.8
Carmil1Q6EDY6 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
Carmil1Q6EDY6 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Carmil1Q6EDY6 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Carmil1Q6EDY6 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Carmil1Q6EDY6 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Carmil1Q6EDY6 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
Carmil1Q6EDY6 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Carmil1Q6EDY6 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC32.53■■■□□ 2.8
Carmil1Q6EDY6 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC32.53■■■□□ 2.8
Carmil1Q6EDY6 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC32.53■■■□□ 2.8
Carmil1Q6EDY6 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC32.53■■■□□ 2.8
Carmil1Q6EDY6 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Carmil1Q6EDY6 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Carmil1Q6EDY6 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Carmil1Q6EDY6 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC32.53■■■□□ 2.8
Carmil1Q6EDY6 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Carmil1Q6EDY6 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Carmil1Q6EDY6 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Carmil1Q6EDY6 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.79
Carmil1Q6EDY6 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
Carmil1Q6EDY6 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC32.51■■■□□ 2.79
Carmil1Q6EDY6 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC32.51■■■□□ 2.79
Carmil1Q6EDY6 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
Carmil1Q6EDY6 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
Carmil1Q6EDY6 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.79
Carmil1Q6EDY6 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Carmil1Q6EDY6 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC32.5■■■□□ 2.79
Carmil1Q6EDY6 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC32.5■■■□□ 2.79
Carmil1Q6EDY6 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC32.5■■■□□ 2.79
Carmil1Q6EDY6 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
Carmil1Q6EDY6 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Carmil1Q6EDY6 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Carmil1Q6EDY6 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Carmil1Q6EDY6 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
Carmil1Q6EDY6 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
Carmil1Q6EDY6 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Carmil1Q6EDY6 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Carmil1Q6EDY6 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
Carmil1Q6EDY6 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Carmil1Q6EDY6 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
Carmil1Q6EDY6 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
Carmil1Q6EDY6 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC32.48■■■□□ 2.79
Carmil1Q6EDY6 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Carmil1Q6EDY6 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
Carmil1Q6EDY6 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Carmil1Q6EDY6 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Carmil1Q6EDY6 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Carmil1Q6EDY6 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Carmil1Q6EDY6 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Carmil1Q6EDY6 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
Carmil1Q6EDY6 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Carmil1Q6EDY6 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Carmil1Q6EDY6 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Carmil1Q6EDY6 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Carmil1Q6EDY6 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms