Protein–RNA interactions for Protein: Q6DIC0

Smarca2, Probable global transcription activator SNF2L2, mousemouse

Predictions only

Length 1,577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca2Q6DIC0 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC37.1■■■■□ 3.53
Smarca2Q6DIC0 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC37.1■■■■□ 3.53
Smarca2Q6DIC0 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC37.09■■■■□ 3.53
Smarca2Q6DIC0 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
Smarca2Q6DIC0 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
Smarca2Q6DIC0 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
Smarca2Q6DIC0 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
Smarca2Q6DIC0 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
Smarca2Q6DIC0 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
Smarca2Q6DIC0 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC37.08■■■■□ 3.53
Smarca2Q6DIC0 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC37.08■■■■□ 3.53
Smarca2Q6DIC0 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
Smarca2Q6DIC0 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.08■■■■□ 3.53
Smarca2Q6DIC0 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.53
Smarca2Q6DIC0 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC37.07■■■■□ 3.52
Smarca2Q6DIC0 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
Smarca2Q6DIC0 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
Smarca2Q6DIC0 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.06■■■■□ 3.52
Smarca2Q6DIC0 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
Smarca2Q6DIC0 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC37.06■■■■□ 3.52
Smarca2Q6DIC0 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
Smarca2Q6DIC0 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
Smarca2Q6DIC0 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC37.05■■■■□ 3.52
Smarca2Q6DIC0 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
Smarca2Q6DIC0 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
Smarca2Q6DIC0 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
Smarca2Q6DIC0 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
Smarca2Q6DIC0 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC37.04■■■■□ 3.52
Smarca2Q6DIC0 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
Smarca2Q6DIC0 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
Smarca2Q6DIC0 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.02■■■■□ 3.52
Smarca2Q6DIC0 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
Smarca2Q6DIC0 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
Smarca2Q6DIC0 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC37.01■■■■□ 3.52
Smarca2Q6DIC0 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37■■■■□ 3.51
Smarca2Q6DIC0 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
Smarca2Q6DIC0 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
Smarca2Q6DIC0 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
Smarca2Q6DIC0 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC37■■■■□ 3.51
Smarca2Q6DIC0 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
Smarca2Q6DIC0 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
Smarca2Q6DIC0 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC37■■■■□ 3.51
Smarca2Q6DIC0 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.99■■■■□ 3.51
Smarca2Q6DIC0 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC36.99■■■■□ 3.51
Smarca2Q6DIC0 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC36.99■■■■□ 3.51
Smarca2Q6DIC0 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
Smarca2Q6DIC0 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
Smarca2Q6DIC0 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
Smarca2Q6DIC0 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC36.98■■■■□ 3.51
Smarca2Q6DIC0 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
Smarca2Q6DIC0 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
Smarca2Q6DIC0 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC36.97■■■■□ 3.51
Smarca2Q6DIC0 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
Smarca2Q6DIC0 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
Smarca2Q6DIC0 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
Smarca2Q6DIC0 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC36.96■■■■□ 3.51
Smarca2Q6DIC0 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
Smarca2Q6DIC0 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC36.95■■■■□ 3.51
Smarca2Q6DIC0 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.95■■■■□ 3.51
Smarca2Q6DIC0 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
Smarca2Q6DIC0 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
Smarca2Q6DIC0 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC36.94■■■■□ 3.5
Smarca2Q6DIC0 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
Smarca2Q6DIC0 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
Smarca2Q6DIC0 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
Smarca2Q6DIC0 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC36.93■■■■□ 3.5
Smarca2Q6DIC0 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
Smarca2Q6DIC0 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
Smarca2Q6DIC0 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
Smarca2Q6DIC0 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
Smarca2Q6DIC0 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
Smarca2Q6DIC0 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
Smarca2Q6DIC0 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
Smarca2Q6DIC0 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
Smarca2Q6DIC0 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.89■■■■□ 3.5
Smarca2Q6DIC0 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
Smarca2Q6DIC0 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
Smarca2Q6DIC0 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.88■■■■□ 3.49
Smarca2Q6DIC0 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC36.88■■■■□ 3.49
Smarca2Q6DIC0 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC36.88■■■■□ 3.49
Smarca2Q6DIC0 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
Smarca2Q6DIC0 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
Smarca2Q6DIC0 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC36.87■■■■□ 3.49
Smarca2Q6DIC0 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.87■■■■□ 3.49
Smarca2Q6DIC0 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
Smarca2Q6DIC0 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
Smarca2Q6DIC0 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC36.87■■■■□ 3.49
Smarca2Q6DIC0 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
Smarca2Q6DIC0 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC36.86■■■■□ 3.49
Smarca2Q6DIC0 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
Smarca2Q6DIC0 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
Smarca2Q6DIC0 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
Smarca2Q6DIC0 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC36.85■■■■□ 3.49
Smarca2Q6DIC0 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC36.85■■■■□ 3.49
Smarca2Q6DIC0 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC36.85■■■■□ 3.49
Smarca2Q6DIC0 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC36.85■■■■□ 3.49
Smarca2Q6DIC0 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
Smarca2Q6DIC0 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
Smarca2Q6DIC0 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC36.84■■■■□ 3.49
Smarca2Q6DIC0 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.2 ms