Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZL1

Fgd6, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgd6Q69ZL1 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Fgd6Q69ZL1 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Fgd6Q69ZL1 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Fgd6Q69ZL1 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.66■■■□□ 2.82
Fgd6Q69ZL1 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Fgd6Q69ZL1 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC32.66■■■□□ 2.82
Fgd6Q69ZL1 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Fgd6Q69ZL1 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC32.65■■■□□ 2.82
Fgd6Q69ZL1 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC32.65■■■□□ 2.82
Fgd6Q69ZL1 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Fgd6Q69ZL1 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Fgd6Q69ZL1 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC32.64■■■□□ 2.82
Fgd6Q69ZL1 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC32.64■■■□□ 2.82
Fgd6Q69ZL1 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC32.64■■■□□ 2.82
Fgd6Q69ZL1 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Fgd6Q69ZL1 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Fgd6Q69ZL1 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Fgd6Q69ZL1 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
Fgd6Q69ZL1 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.63■■■□□ 2.81
Fgd6Q69ZL1 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Fgd6Q69ZL1 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC32.62■■■□□ 2.81
Fgd6Q69ZL1 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Fgd6Q69ZL1 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Fgd6Q69ZL1 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Fgd6Q69ZL1 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
Fgd6Q69ZL1 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Fgd6Q69ZL1 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Fgd6Q69ZL1 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
Fgd6Q69ZL1 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Fgd6Q69ZL1 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Fgd6Q69ZL1 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Fgd6Q69ZL1 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
Fgd6Q69ZL1 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Fgd6Q69ZL1 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Fgd6Q69ZL1 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Fgd6Q69ZL1 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Fgd6Q69ZL1 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Fgd6Q69ZL1 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
Fgd6Q69ZL1 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
Fgd6Q69ZL1 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Fgd6Q69ZL1 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Fgd6Q69ZL1 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
Fgd6Q69ZL1 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
Fgd6Q69ZL1 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Fgd6Q69ZL1 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Fgd6Q69ZL1 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC32.58■■■□□ 2.81
Fgd6Q69ZL1 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
Fgd6Q69ZL1 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC32.58■■■□□ 2.81
Fgd6Q69ZL1 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Fgd6Q69ZL1 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Fgd6Q69ZL1 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Fgd6Q69ZL1 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
Fgd6Q69ZL1 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Fgd6Q69ZL1 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Fgd6Q69ZL1 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Fgd6Q69ZL1 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Fgd6Q69ZL1 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
Fgd6Q69ZL1 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Fgd6Q69ZL1 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC32.56■■■□□ 2.8
Fgd6Q69ZL1 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
Fgd6Q69ZL1 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
Fgd6Q69ZL1 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC32.56■■■□□ 2.8
Fgd6Q69ZL1 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
Fgd6Q69ZL1 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Fgd6Q69ZL1 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Fgd6Q69ZL1 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Fgd6Q69ZL1 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Fgd6Q69ZL1 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Fgd6Q69ZL1 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Fgd6Q69ZL1 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC32.53■■■□□ 2.8
Fgd6Q69ZL1 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Fgd6Q69ZL1 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Fgd6Q69ZL1 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Fgd6Q69ZL1 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Fgd6Q69ZL1 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC32.52■■■□□ 2.8
Fgd6Q69ZL1 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Fgd6Q69ZL1 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Fgd6Q69ZL1 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Fgd6Q69ZL1 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Fgd6Q69ZL1 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.79
Fgd6Q69ZL1 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC32.51■■■□□ 2.79
Fgd6Q69ZL1 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
Fgd6Q69ZL1 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
Fgd6Q69ZL1 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
Fgd6Q69ZL1 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
Fgd6Q69ZL1 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Fgd6Q69ZL1 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Fgd6Q69ZL1 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Fgd6Q69ZL1 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
Fgd6Q69ZL1 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Fgd6Q69ZL1 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC32.49■■■□□ 2.79
Fgd6Q69ZL1 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Fgd6Q69ZL1 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Fgd6Q69ZL1 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Fgd6Q69ZL1 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Fgd6Q69ZL1 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Fgd6Q69ZL1 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC32.48■■■□□ 2.79
Fgd6Q69ZL1 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Fgd6Q69ZL1 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Fgd6Q69ZL1 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 103.2 ms