Protein–RNA interactions for Protein: Q68FH0

Pkp4, Plakophilin-4, mousemouse

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Length 1,190 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp4Q68FH0 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Pkp4Q68FH0 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Pkp4Q68FH0 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Pkp4Q68FH0 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Pkp4Q68FH0 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Pkp4Q68FH0 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Pkp4Q68FH0 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Pkp4Q68FH0 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Pkp4Q68FH0 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Pkp4Q68FH0 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Pkp4Q68FH0 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Pkp4Q68FH0 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Pkp4Q68FH0 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Pkp4Q68FH0 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Pkp4Q68FH0 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Pkp4Q68FH0 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Pkp4Q68FH0 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Pkp4Q68FH0 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Pkp4Q68FH0 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Pkp4Q68FH0 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Pkp4Q68FH0 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Pkp4Q68FH0 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Pkp4Q68FH0 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Pkp4Q68FH0 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Pkp4Q68FH0 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Pkp4Q68FH0 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Pkp4Q68FH0 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Pkp4Q68FH0 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Pkp4Q68FH0 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Pkp4Q68FH0 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Pkp4Q68FH0 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Pkp4Q68FH0 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Pkp4Q68FH0 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Pkp4Q68FH0 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Pkp4Q68FH0 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Pkp4Q68FH0 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Pkp4Q68FH0 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Pkp4Q68FH0 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Pkp4Q68FH0 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Pkp4Q68FH0 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Pkp4Q68FH0 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Pkp4Q68FH0 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Pkp4Q68FH0 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Pkp4Q68FH0 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Pkp4Q68FH0 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Pkp4Q68FH0 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Pkp4Q68FH0 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pkp4Q68FH0 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pkp4Q68FH0 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pkp4Q68FH0 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pkp4Q68FH0 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pkp4Q68FH0 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pkp4Q68FH0 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pkp4Q68FH0 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pkp4Q68FH0 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pkp4Q68FH0 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pkp4Q68FH0 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pkp4Q68FH0 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pkp4Q68FH0 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pkp4Q68FH0 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pkp4Q68FH0 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pkp4Q68FH0 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pkp4Q68FH0 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pkp4Q68FH0 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Pkp4Q68FH0 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Pkp4Q68FH0 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Pkp4Q68FH0 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Pkp4Q68FH0 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Pkp4Q68FH0 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Pkp4Q68FH0 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Pkp4Q68FH0 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Pkp4Q68FH0 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Pkp4Q68FH0 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Pkp4Q68FH0 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Pkp4Q68FH0 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Pkp4Q68FH0 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pkp4Q68FH0 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pkp4Q68FH0 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pkp4Q68FH0 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pkp4Q68FH0 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pkp4Q68FH0 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pkp4Q68FH0 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pkp4Q68FH0 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pkp4Q68FH0 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pkp4Q68FH0 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Pkp4Q68FH0 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pkp4Q68FH0 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pkp4Q68FH0 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pkp4Q68FH0 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pkp4Q68FH0 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Pkp4Q68FH0 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pkp4Q68FH0 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pkp4Q68FH0 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pkp4Q68FH0 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pkp4Q68FH0 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pkp4Q68FH0 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pkp4Q68FH0 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pkp4Q68FH0 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pkp4Q68FH0 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pkp4Q68FH0 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
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