Protein–RNA interactions for Protein: Q65CL1

Ctnna3, Catenin alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna3Q65CL1 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ctnna3Q65CL1 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ctnna3Q65CL1 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ctnna3Q65CL1 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ctnna3Q65CL1 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ctnna3Q65CL1 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ctnna3Q65CL1 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ctnna3Q65CL1 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ctnna3Q65CL1 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ctnna3Q65CL1 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ctnna3Q65CL1 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ctnna3Q65CL1 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ctnna3Q65CL1 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ctnna3Q65CL1 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ctnna3Q65CL1 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ctnna3Q65CL1 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ctnna3Q65CL1 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ctnna3Q65CL1 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ctnna3Q65CL1 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ctnna3Q65CL1 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ctnna3Q65CL1 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ctnna3Q65CL1 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ctnna3Q65CL1 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ctnna3Q65CL1 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ctnna3Q65CL1 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ctnna3Q65CL1 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ctnna3Q65CL1 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Ctnna3Q65CL1 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ctnna3Q65CL1 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Ctnna3Q65CL1 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Ctnna3Q65CL1 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Ctnna3Q65CL1 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ctnna3Q65CL1 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ctnna3Q65CL1 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Ctnna3Q65CL1 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Ctnna3Q65CL1 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ctnna3Q65CL1 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ctnna3Q65CL1 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Ctnna3Q65CL1 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ctnna3Q65CL1 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ctnna3Q65CL1 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ctnna3Q65CL1 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ctnna3Q65CL1 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Ctnna3Q65CL1 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ctnna3Q65CL1 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ctnna3Q65CL1 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ctnna3Q65CL1 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ctnna3Q65CL1 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ctnna3Q65CL1 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ctnna3Q65CL1 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ctnna3Q65CL1 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ctnna3Q65CL1 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ctnna3Q65CL1 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ctnna3Q65CL1 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ctnna3Q65CL1 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ctnna3Q65CL1 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ctnna3Q65CL1 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ctnna3Q65CL1 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ctnna3Q65CL1 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Ctnna3Q65CL1 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ctnna3Q65CL1 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ctnna3Q65CL1 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ctnna3Q65CL1 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ctnna3Q65CL1 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ctnna3Q65CL1 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ctnna3Q65CL1 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ctnna3Q65CL1 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ctnna3Q65CL1 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ctnna3Q65CL1 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ctnna3Q65CL1 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ctnna3Q65CL1 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ctnna3Q65CL1 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ctnna3Q65CL1 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ctnna3Q65CL1 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ctnna3Q65CL1 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ctnna3Q65CL1 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ctnna3Q65CL1 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ctnna3Q65CL1 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ctnna3Q65CL1 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ctnna3Q65CL1 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ctnna3Q65CL1 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ctnna3Q65CL1 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ctnna3Q65CL1 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ctnna3Q65CL1 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ctnna3Q65CL1 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ctnna3Q65CL1 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ctnna3Q65CL1 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Ctnna3Q65CL1 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ctnna3Q65CL1 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ctnna3Q65CL1 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ctnna3Q65CL1 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ctnna3Q65CL1 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ctnna3Q65CL1 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ctnna3Q65CL1 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ctnna3Q65CL1 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Ctnna3Q65CL1 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ctnna3Q65CL1 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ctnna3Q65CL1 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ctnna3Q65CL1 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ctnna3Q65CL1 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.3 ms