Protein–RNA interactions for Protein: Q64104

Nr2e1, Nuclear receptor subfamily 2 group E member 1, mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr2e1Q64104 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nr2e1Q64104 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nr2e1Q64104 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nr2e1Q64104 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Nr2e1Q64104 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nr2e1Q64104 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nr2e1Q64104 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nr2e1Q64104 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Nr2e1Q64104 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nr2e1Q64104 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nr2e1Q64104 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nr2e1Q64104 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nr2e1Q64104 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nr2e1Q64104 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nr2e1Q64104 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Nr2e1Q64104 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Nr2e1Q64104 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Nr2e1Q64104 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nr2e1Q64104 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Nr2e1Q64104 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Nr2e1Q64104 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nr2e1Q64104 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nr2e1Q64104 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nr2e1Q64104 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nr2e1Q64104 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nr2e1Q64104 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nr2e1Q64104 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nr2e1Q64104 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nr2e1Q64104 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nr2e1Q64104 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nr2e1Q64104 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nr2e1Q64104 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nr2e1Q64104 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nr2e1Q64104 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nr2e1Q64104 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nr2e1Q64104 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Nr2e1Q64104 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nr2e1Q64104 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nr2e1Q64104 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nr2e1Q64104 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nr2e1Q64104 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Nr2e1Q64104 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nr2e1Q64104 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nr2e1Q64104 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nr2e1Q64104 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nr2e1Q64104 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nr2e1Q64104 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nr2e1Q64104 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nr2e1Q64104 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Nr2e1Q64104 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nr2e1Q64104 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nr2e1Q64104 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nr2e1Q64104 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nr2e1Q64104 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nr2e1Q64104 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nr2e1Q64104 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nr2e1Q64104 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nr2e1Q64104 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nr2e1Q64104 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nr2e1Q64104 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nr2e1Q64104 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nr2e1Q64104 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nr2e1Q64104 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nr2e1Q64104 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nr2e1Q64104 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nr2e1Q64104 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nr2e1Q64104 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nr2e1Q64104 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nr2e1Q64104 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nr2e1Q64104 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nr2e1Q64104 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nr2e1Q64104 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Nr2e1Q64104 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Nr2e1Q64104 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nr2e1Q64104 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nr2e1Q64104 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nr2e1Q64104 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nr2e1Q64104 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nr2e1Q64104 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nr2e1Q64104 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nr2e1Q64104 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nr2e1Q64104 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nr2e1Q64104 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nr2e1Q64104 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nr2e1Q64104 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Nr2e1Q64104 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nr2e1Q64104 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nr2e1Q64104 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nr2e1Q64104 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22■■□□□ 1.11
Nr2e1Q64104 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nr2e1Q64104 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nr2e1Q64104 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nr2e1Q64104 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nr2e1Q64104 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nr2e1Q64104 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nr2e1Q64104 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nr2e1Q64104 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nr2e1Q64104 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nr2e1Q64104 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nr2e1Q64104 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms