Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

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Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Ccdc18Q640L5 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Ccdc18Q640L5 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Ccdc18Q640L5 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
Ccdc18Q640L5 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC34.17■■■■□ 3.06
Ccdc18Q640L5 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
Ccdc18Q640L5 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Ccdc18Q640L5 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
Ccdc18Q640L5 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC34.16■■■■□ 3.06
Ccdc18Q640L5 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Ccdc18Q640L5 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Ccdc18Q640L5 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Ccdc18Q640L5 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Ccdc18Q640L5 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
Ccdc18Q640L5 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Ccdc18Q640L5 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Ccdc18Q640L5 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC34.13■■■■□ 3.05
Ccdc18Q640L5 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
Ccdc18Q640L5 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC34.12■■■■□ 3.05
Ccdc18Q640L5 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Ccdc18Q640L5 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Ccdc18Q640L5 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
Ccdc18Q640L5 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Ccdc18Q640L5 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
Ccdc18Q640L5 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Ccdc18Q640L5 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC34.11■■■■□ 3.05
Ccdc18Q640L5 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
Ccdc18Q640L5 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC34.1■■■■□ 3.05
Ccdc18Q640L5 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Ccdc18Q640L5 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Ccdc18Q640L5 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
Ccdc18Q640L5 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
Ccdc18Q640L5 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Ccdc18Q640L5 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Ccdc18Q640L5 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
Ccdc18Q640L5 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
Ccdc18Q640L5 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC34.07■■■■□ 3.04
Ccdc18Q640L5 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
Ccdc18Q640L5 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
Ccdc18Q640L5 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Ccdc18Q640L5 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC34.06■■■■□ 3.04
Ccdc18Q640L5 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC34.06■■■■□ 3.04
Ccdc18Q640L5 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Ccdc18Q640L5 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Ccdc18Q640L5 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Ccdc18Q640L5 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Ccdc18Q640L5 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Ccdc18Q640L5 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Ccdc18Q640L5 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
Ccdc18Q640L5 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Ccdc18Q640L5 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Ccdc18Q640L5 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Ccdc18Q640L5 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Ccdc18Q640L5 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
Ccdc18Q640L5 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
Ccdc18Q640L5 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Ccdc18Q640L5 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Ccdc18Q640L5 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Ccdc18Q640L5 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Ccdc18Q640L5 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Ccdc18Q640L5 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.04
Ccdc18Q640L5 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
Ccdc18Q640L5 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
Ccdc18Q640L5 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
Ccdc18Q640L5 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
Ccdc18Q640L5 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC34.01■■■■□ 3.03
Ccdc18Q640L5 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
Ccdc18Q640L5 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
Ccdc18Q640L5 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC34.01■■■■□ 3.03
Ccdc18Q640L5 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC34.01■■■■□ 3.03
Ccdc18Q640L5 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
Ccdc18Q640L5 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
Ccdc18Q640L5 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Ccdc18Q640L5 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Ccdc18Q640L5 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Ccdc18Q640L5 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
Ccdc18Q640L5 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Ccdc18Q640L5 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
Ccdc18Q640L5 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
Ccdc18Q640L5 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Ccdc18Q640L5 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Ccdc18Q640L5 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Ccdc18Q640L5 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Ccdc18Q640L5 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC33.99■■■■□ 3.03
Ccdc18Q640L5 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC33.98■■■■□ 3.03
Ccdc18Q640L5 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC33.98■■■■□ 3.03
Ccdc18Q640L5 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Ccdc18Q640L5 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC33.98■■■■□ 3.03
Ccdc18Q640L5 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Ccdc18Q640L5 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Ccdc18Q640L5 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
Ccdc18Q640L5 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
Ccdc18Q640L5 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Ccdc18Q640L5 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Ccdc18Q640L5 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC33.97■■■■□ 3.03
Ccdc18Q640L5 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Ccdc18Q640L5 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
Ccdc18Q640L5 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Ccdc18Q640L5 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC33.96■■■■□ 3.03
Ccdc18Q640L5 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
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