Protein–RNA interactions for Protein: Q63ZW7

Patj, InaD-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,834 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PatjQ63ZW7 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PatjQ63ZW7 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PatjQ63ZW7 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PatjQ63ZW7 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PatjQ63ZW7 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PatjQ63ZW7 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PatjQ63ZW7 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PatjQ63ZW7 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PatjQ63ZW7 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PatjQ63ZW7 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PatjQ63ZW7 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PatjQ63ZW7 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PatjQ63ZW7 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PatjQ63ZW7 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PatjQ63ZW7 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PatjQ63ZW7 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PatjQ63ZW7 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PatjQ63ZW7 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PatjQ63ZW7 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PatjQ63ZW7 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PatjQ63ZW7 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PatjQ63ZW7 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PatjQ63ZW7 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC23.2■■□□□ 1.31
PatjQ63ZW7 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PatjQ63ZW7 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PatjQ63ZW7 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PatjQ63ZW7 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PatjQ63ZW7 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PatjQ63ZW7 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PatjQ63ZW7 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PatjQ63ZW7 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PatjQ63ZW7 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PatjQ63ZW7 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PatjQ63ZW7 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PatjQ63ZW7 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PatjQ63ZW7 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PatjQ63ZW7 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PatjQ63ZW7 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PatjQ63ZW7 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PatjQ63ZW7 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PatjQ63ZW7 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PatjQ63ZW7 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PatjQ63ZW7 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PatjQ63ZW7 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PatjQ63ZW7 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PatjQ63ZW7 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PatjQ63ZW7 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PatjQ63ZW7 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PatjQ63ZW7 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PatjQ63ZW7 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PatjQ63ZW7 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PatjQ63ZW7 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PatjQ63ZW7 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PatjQ63ZW7 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PatjQ63ZW7 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PatjQ63ZW7 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PatjQ63ZW7 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PatjQ63ZW7 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PatjQ63ZW7 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PatjQ63ZW7 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PatjQ63ZW7 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
PatjQ63ZW7 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PatjQ63ZW7 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PatjQ63ZW7 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PatjQ63ZW7 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PatjQ63ZW7 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PatjQ63ZW7 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PatjQ63ZW7 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PatjQ63ZW7 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PatjQ63ZW7 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PatjQ63ZW7 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PatjQ63ZW7 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PatjQ63ZW7 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PatjQ63ZW7 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PatjQ63ZW7 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PatjQ63ZW7 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PatjQ63ZW7 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PatjQ63ZW7 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PatjQ63ZW7 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PatjQ63ZW7 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PatjQ63ZW7 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PatjQ63ZW7 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PatjQ63ZW7 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PatjQ63ZW7 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PatjQ63ZW7 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PatjQ63ZW7 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PatjQ63ZW7 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PatjQ63ZW7 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PatjQ63ZW7 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PatjQ63ZW7 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PatjQ63ZW7 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PatjQ63ZW7 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PatjQ63ZW7 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PatjQ63ZW7 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PatjQ63ZW7 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PatjQ63ZW7 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PatjQ63ZW7 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PatjQ63ZW7 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PatjQ63ZW7 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PatjQ63ZW7 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.1 ms