Protein–RNA interactions for Protein: Q62443

Nptx1, Neuronal pentraxin-1, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nptx1Q62443 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nptx1Q62443 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nptx1Q62443 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nptx1Q62443 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Nptx1Q62443 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nptx1Q62443 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nptx1Q62443 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nptx1Q62443 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nptx1Q62443 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nptx1Q62443 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nptx1Q62443 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nptx1Q62443 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nptx1Q62443 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nptx1Q62443 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nptx1Q62443 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nptx1Q62443 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nptx1Q62443 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nptx1Q62443 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Nptx1Q62443 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nptx1Q62443 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nptx1Q62443 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nptx1Q62443 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nptx1Q62443 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nptx1Q62443 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nptx1Q62443 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nptx1Q62443 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nptx1Q62443 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nptx1Q62443 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nptx1Q62443 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nptx1Q62443 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nptx1Q62443 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nptx1Q62443 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nptx1Q62443 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nptx1Q62443 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nptx1Q62443 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nptx1Q62443 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nptx1Q62443 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nptx1Q62443 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nptx1Q62443 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nptx1Q62443 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nptx1Q62443 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nptx1Q62443 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nptx1Q62443 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nptx1Q62443 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nptx1Q62443 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nptx1Q62443 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nptx1Q62443 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nptx1Q62443 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nptx1Q62443 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nptx1Q62443 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nptx1Q62443 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nptx1Q62443 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nptx1Q62443 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nptx1Q62443 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Nptx1Q62443 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nptx1Q62443 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nptx1Q62443 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nptx1Q62443 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nptx1Q62443 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nptx1Q62443 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nptx1Q62443 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nptx1Q62443 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nptx1Q62443 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nptx1Q62443 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nptx1Q62443 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nptx1Q62443 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nptx1Q62443 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nptx1Q62443 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nptx1Q62443 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nptx1Q62443 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Nptx1Q62443 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nptx1Q62443 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nptx1Q62443 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nptx1Q62443 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nptx1Q62443 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nptx1Q62443 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nptx1Q62443 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nptx1Q62443 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nptx1Q62443 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nptx1Q62443 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nptx1Q62443 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nptx1Q62443 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nptx1Q62443 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nptx1Q62443 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nptx1Q62443 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nptx1Q62443 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nptx1Q62443 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nptx1Q62443 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Nptx1Q62443 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nptx1Q62443 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nptx1Q62443 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nptx1Q62443 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nptx1Q62443 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nptx1Q62443 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nptx1Q62443 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nptx1Q62443 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nptx1Q62443 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nptx1Q62443 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nptx1Q62443 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nptx1Q62443 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms