Protein–RNA interactions for Protein: Q62442

Vamp1, Vesicle-associated membrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp1Q62442 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vamp1Q62442 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vamp1Q62442 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vamp1Q62442 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vamp1Q62442 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vamp1Q62442 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vamp1Q62442 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vamp1Q62442 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Vamp1Q62442 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vamp1Q62442 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vamp1Q62442 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vamp1Q62442 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vamp1Q62442 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vamp1Q62442 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vamp1Q62442 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vamp1Q62442 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vamp1Q62442 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vamp1Q62442 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vamp1Q62442 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vamp1Q62442 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vamp1Q62442 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vamp1Q62442 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vamp1Q62442 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vamp1Q62442 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vamp1Q62442 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vamp1Q62442 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vamp1Q62442 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vamp1Q62442 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vamp1Q62442 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vamp1Q62442 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vamp1Q62442 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vamp1Q62442 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vamp1Q62442 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vamp1Q62442 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vamp1Q62442 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Vamp1Q62442 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vamp1Q62442 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vamp1Q62442 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vamp1Q62442 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vamp1Q62442 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vamp1Q62442 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vamp1Q62442 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vamp1Q62442 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vamp1Q62442 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vamp1Q62442 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vamp1Q62442 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Vamp1Q62442 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vamp1Q62442 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vamp1Q62442 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vamp1Q62442 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vamp1Q62442 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vamp1Q62442 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vamp1Q62442 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vamp1Q62442 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vamp1Q62442 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vamp1Q62442 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vamp1Q62442 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vamp1Q62442 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vamp1Q62442 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vamp1Q62442 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Vamp1Q62442 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vamp1Q62442 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vamp1Q62442 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vamp1Q62442 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vamp1Q62442 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vamp1Q62442 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vamp1Q62442 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vamp1Q62442 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vamp1Q62442 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vamp1Q62442 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vamp1Q62442 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vamp1Q62442 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vamp1Q62442 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vamp1Q62442 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vamp1Q62442 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vamp1Q62442 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vamp1Q62442 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vamp1Q62442 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vamp1Q62442 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vamp1Q62442 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vamp1Q62442 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vamp1Q62442 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vamp1Q62442 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vamp1Q62442 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vamp1Q62442 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vamp1Q62442 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vamp1Q62442 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vamp1Q62442 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vamp1Q62442 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vamp1Q62442 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vamp1Q62442 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vamp1Q62442 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vamp1Q62442 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vamp1Q62442 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vamp1Q62442 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vamp1Q62442 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vamp1Q62442 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vamp1Q62442 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Vamp1Q62442 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vamp1Q62442 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms