Protein–RNA interactions for Protein: Q62417

Sorbs1, Sorbin and SH3 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sorbs1Q62417 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sorbs1Q62417 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sorbs1Q62417 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sorbs1Q62417 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sorbs1Q62417 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sorbs1Q62417 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sorbs1Q62417 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Sorbs1Q62417 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sorbs1Q62417 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sorbs1Q62417 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sorbs1Q62417 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sorbs1Q62417 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sorbs1Q62417 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sorbs1Q62417 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sorbs1Q62417 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Sorbs1Q62417 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sorbs1Q62417 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sorbs1Q62417 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sorbs1Q62417 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sorbs1Q62417 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sorbs1Q62417 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sorbs1Q62417 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sorbs1Q62417 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sorbs1Q62417 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sorbs1Q62417 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Sorbs1Q62417 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Sorbs1Q62417 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sorbs1Q62417 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sorbs1Q62417 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sorbs1Q62417 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sorbs1Q62417 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sorbs1Q62417 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sorbs1Q62417 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Sorbs1Q62417 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sorbs1Q62417 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sorbs1Q62417 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sorbs1Q62417 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sorbs1Q62417 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sorbs1Q62417 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sorbs1Q62417 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sorbs1Q62417 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sorbs1Q62417 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sorbs1Q62417 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sorbs1Q62417 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sorbs1Q62417 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sorbs1Q62417 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Sorbs1Q62417 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sorbs1Q62417 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sorbs1Q62417 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sorbs1Q62417 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sorbs1Q62417 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sorbs1Q62417 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Sorbs1Q62417 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sorbs1Q62417 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Sorbs1Q62417 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Sorbs1Q62417 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sorbs1Q62417 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sorbs1Q62417 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sorbs1Q62417 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sorbs1Q62417 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sorbs1Q62417 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sorbs1Q62417 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sorbs1Q62417 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sorbs1Q62417 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sorbs1Q62417 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sorbs1Q62417 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sorbs1Q62417 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sorbs1Q62417 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sorbs1Q62417 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sorbs1Q62417 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sorbs1Q62417 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sorbs1Q62417 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sorbs1Q62417 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sorbs1Q62417 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sorbs1Q62417 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sorbs1Q62417 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sorbs1Q62417 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sorbs1Q62417 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sorbs1Q62417 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sorbs1Q62417 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sorbs1Q62417 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sorbs1Q62417 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sorbs1Q62417 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sorbs1Q62417 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sorbs1Q62417 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sorbs1Q62417 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sorbs1Q62417 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sorbs1Q62417 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sorbs1Q62417 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sorbs1Q62417 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sorbs1Q62417 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sorbs1Q62417 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sorbs1Q62417 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sorbs1Q62417 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sorbs1Q62417 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sorbs1Q62417 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Sorbs1Q62417 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Sorbs1Q62417 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sorbs1Q62417 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sorbs1Q62417 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms