Protein–RNA interactions for Protein: Q62376

Snrnp70, U1 small nuclear ribonucleoprotein 70 kDa, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 448 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrnp70Q62376 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snrnp70Q62376 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snrnp70Q62376 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snrnp70Q62376 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snrnp70Q62376 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snrnp70Q62376 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snrnp70Q62376 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snrnp70Q62376 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snrnp70Q62376 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snrnp70Q62376 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snrnp70Q62376 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Snrnp70Q62376 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Snrnp70Q62376 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Snrnp70Q62376 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Snrnp70Q62376 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Snrnp70Q62376 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Snrnp70Q62376 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Snrnp70Q62376 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Snrnp70Q62376 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Snrnp70Q62376 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Snrnp70Q62376 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Snrnp70Q62376 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snrnp70Q62376 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snrnp70Q62376 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snrnp70Q62376 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Snrnp70Q62376 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snrnp70Q62376 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snrnp70Q62376 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snrnp70Q62376 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Snrnp70Q62376 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Snrnp70Q62376 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Snrnp70Q62376 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snrnp70Q62376 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snrnp70Q62376 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snrnp70Q62376 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snrnp70Q62376 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snrnp70Q62376 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snrnp70Q62376 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snrnp70Q62376 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snrnp70Q62376 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snrnp70Q62376 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snrnp70Q62376 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snrnp70Q62376 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snrnp70Q62376 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snrnp70Q62376 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snrnp70Q62376 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snrnp70Q62376 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snrnp70Q62376 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snrnp70Q62376 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snrnp70Q62376 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snrnp70Q62376 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snrnp70Q62376 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snrnp70Q62376 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snrnp70Q62376 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snrnp70Q62376 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snrnp70Q62376 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snrnp70Q62376 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snrnp70Q62376 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Snrnp70Q62376 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snrnp70Q62376 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snrnp70Q62376 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snrnp70Q62376 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snrnp70Q62376 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snrnp70Q62376 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snrnp70Q62376 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snrnp70Q62376 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snrnp70Q62376 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snrnp70Q62376 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snrnp70Q62376 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snrnp70Q62376 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snrnp70Q62376 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Snrnp70Q62376 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snrnp70Q62376 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snrnp70Q62376 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snrnp70Q62376 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snrnp70Q62376 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snrnp70Q62376 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snrnp70Q62376 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snrnp70Q62376 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snrnp70Q62376 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snrnp70Q62376 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snrnp70Q62376 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snrnp70Q62376 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snrnp70Q62376 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snrnp70Q62376 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snrnp70Q62376 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snrnp70Q62376 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snrnp70Q62376 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snrnp70Q62376 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snrnp70Q62376 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Snrnp70Q62376 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snrnp70Q62376 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snrnp70Q62376 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Snrnp70Q62376 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snrnp70Q62376 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snrnp70Q62376 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snrnp70Q62376 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snrnp70Q62376 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snrnp70Q62376 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snrnp70Q62376 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms