Protein–RNA interactions for Protein: Q62311

Taf6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf6Q62311 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Taf6Q62311 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Taf6Q62311 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Taf6Q62311 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Taf6Q62311 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Taf6Q62311 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Taf6Q62311 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Taf6Q62311 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Taf6Q62311 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Taf6Q62311 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Taf6Q62311 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Taf6Q62311 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Taf6Q62311 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Taf6Q62311 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Taf6Q62311 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Taf6Q62311 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Taf6Q62311 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Taf6Q62311 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Taf6Q62311 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Taf6Q62311 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Taf6Q62311 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Taf6Q62311 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Taf6Q62311 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Taf6Q62311 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Taf6Q62311 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Taf6Q62311 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Taf6Q62311 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Taf6Q62311 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Taf6Q62311 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Taf6Q62311 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Taf6Q62311 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Taf6Q62311 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Taf6Q62311 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Taf6Q62311 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Taf6Q62311 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Taf6Q62311 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Taf6Q62311 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Taf6Q62311 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Taf6Q62311 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Taf6Q62311 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Taf6Q62311 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Taf6Q62311 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Taf6Q62311 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Taf6Q62311 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Taf6Q62311 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Taf6Q62311 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Taf6Q62311 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Taf6Q62311 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Taf6Q62311 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Taf6Q62311 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Taf6Q62311 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Taf6Q62311 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Taf6Q62311 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Taf6Q62311 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Taf6Q62311 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Taf6Q62311 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Taf6Q62311 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Taf6Q62311 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Taf6Q62311 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Taf6Q62311 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Taf6Q62311 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Taf6Q62311 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Taf6Q62311 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Taf6Q62311 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Taf6Q62311 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Taf6Q62311 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Taf6Q62311 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Taf6Q62311 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Taf6Q62311 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Taf6Q62311 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Taf6Q62311 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Taf6Q62311 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Taf6Q62311 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Taf6Q62311 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Taf6Q62311 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Taf6Q62311 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Taf6Q62311 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Taf6Q62311 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Taf6Q62311 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Taf6Q62311 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Taf6Q62311 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Taf6Q62311 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Taf6Q62311 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Taf6Q62311 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Taf6Q62311 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Taf6Q62311 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Taf6Q62311 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Taf6Q62311 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Taf6Q62311 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Taf6Q62311 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Taf6Q62311 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Taf6Q62311 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Taf6Q62311 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Taf6Q62311 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Taf6Q62311 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Taf6Q62311 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Taf6Q62311 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Taf6Q62311 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Taf6Q62311 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Taf6Q62311 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms