Protein–RNA interactions for Protein: Q62277

Syp, Synaptophysin, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SypQ62277 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SypQ62277 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SypQ62277 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SypQ62277 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SypQ62277 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SypQ62277 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SypQ62277 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SypQ62277 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SypQ62277 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SypQ62277 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
SypQ62277 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SypQ62277 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SypQ62277 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SypQ62277 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SypQ62277 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SypQ62277 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SypQ62277 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SypQ62277 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SypQ62277 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SypQ62277 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SypQ62277 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SypQ62277 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SypQ62277 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SypQ62277 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SypQ62277 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SypQ62277 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SypQ62277 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SypQ62277 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SypQ62277 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
SypQ62277 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SypQ62277 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SypQ62277 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SypQ62277 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SypQ62277 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SypQ62277 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SypQ62277 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SypQ62277 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SypQ62277 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SypQ62277 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
SypQ62277 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SypQ62277 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SypQ62277 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SypQ62277 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SypQ62277 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SypQ62277 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SypQ62277 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SypQ62277 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SypQ62277 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SypQ62277 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SypQ62277 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SypQ62277 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SypQ62277 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SypQ62277 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
SypQ62277 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
SypQ62277 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SypQ62277 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SypQ62277 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SypQ62277 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SypQ62277 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SypQ62277 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SypQ62277 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SypQ62277 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
SypQ62277 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SypQ62277 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SypQ62277 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SypQ62277 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SypQ62277 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SypQ62277 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
SypQ62277 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SypQ62277 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SypQ62277 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SypQ62277 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SypQ62277 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SypQ62277 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SypQ62277 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SypQ62277 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SypQ62277 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SypQ62277 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SypQ62277 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SypQ62277 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SypQ62277 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SypQ62277 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SypQ62277 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SypQ62277 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SypQ62277 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SypQ62277 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SypQ62277 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SypQ62277 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SypQ62277 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SypQ62277 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
SypQ62277 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SypQ62277 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SypQ62277 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SypQ62277 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SypQ62277 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SypQ62277 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SypQ62277 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SypQ62277 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SypQ62277 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SypQ62277 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms