Protein–RNA interactions for Protein: Q62233

Six3, Homeobox protein SIX3, mousemouse

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Length 333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Six3Q62233 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Six3Q62233 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Six3Q62233 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Six3Q62233 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Six3Q62233 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Six3Q62233 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Six3Q62233 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Six3Q62233 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Six3Q62233 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Six3Q62233 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Six3Q62233 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Six3Q62233 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Six3Q62233 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Six3Q62233 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Six3Q62233 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Six3Q62233 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Six3Q62233 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Six3Q62233 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Six3Q62233 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Six3Q62233 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Six3Q62233 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
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Six3Q62233 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Six3Q62233 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Six3Q62233 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Six3Q62233 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Six3Q62233 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Six3Q62233 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Six3Q62233 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Six3Q62233 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Six3Q62233 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Six3Q62233 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Six3Q62233 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Six3Q62233 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Six3Q62233 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Six3Q62233 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Six3Q62233 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Six3Q62233 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Six3Q62233 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Six3Q62233 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Six3Q62233 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Six3Q62233 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Six3Q62233 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Six3Q62233 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Six3Q62233 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
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Six3Q62233 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Six3Q62233 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Six3Q62233 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Six3Q62233 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Six3Q62233 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Six3Q62233 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Six3Q62233 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Six3Q62233 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Six3Q62233 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
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Six3Q62233 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Six3Q62233 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
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Six3Q62233 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Six3Q62233 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
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Six3Q62233 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
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Six3Q62233 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Six3Q62233 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Six3Q62233 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Six3Q62233 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Six3Q62233 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Six3Q62233 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Six3Q62233 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Six3Q62233 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Six3Q62233 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Six3Q62233 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
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Six3Q62233 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Six3Q62233 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Six3Q62233 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Six3Q62233 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Six3Q62233 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Six3Q62233 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Six3Q62233 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Six3Q62233 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Six3Q62233 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Six3Q62233 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Six3Q62233 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Six3Q62233 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Six3Q62233 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Six3Q62233 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Six3Q62233 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Six3Q62233 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Six3Q62233 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Six3Q62233 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Six3Q62233 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms