Protein–RNA interactions for Protein: Q62179

Sema4b, Semaphorin-4B, mousemouse

Predictions only

Length 823 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema4bQ62179 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sema4bQ62179 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sema4bQ62179 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sema4bQ62179 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sema4bQ62179 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sema4bQ62179 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sema4bQ62179 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sema4bQ62179 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sema4bQ62179 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Sema4bQ62179 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sema4bQ62179 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sema4bQ62179 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sema4bQ62179 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Sema4bQ62179 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sema4bQ62179 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sema4bQ62179 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sema4bQ62179 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sema4bQ62179 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sema4bQ62179 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sema4bQ62179 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Sema4bQ62179 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sema4bQ62179 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sema4bQ62179 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sema4bQ62179 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sema4bQ62179 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sema4bQ62179 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sema4bQ62179 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sema4bQ62179 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sema4bQ62179 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sema4bQ62179 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sema4bQ62179 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sema4bQ62179 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sema4bQ62179 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sema4bQ62179 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sema4bQ62179 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sema4bQ62179 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Sema4bQ62179 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sema4bQ62179 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sema4bQ62179 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sema4bQ62179 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Sema4bQ62179 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sema4bQ62179 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sema4bQ62179 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sema4bQ62179 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sema4bQ62179 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sema4bQ62179 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sema4bQ62179 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sema4bQ62179 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Sema4bQ62179 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sema4bQ62179 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sema4bQ62179 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sema4bQ62179 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sema4bQ62179 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sema4bQ62179 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sema4bQ62179 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Sema4bQ62179 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Sema4bQ62179 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Sema4bQ62179 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sema4bQ62179 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sema4bQ62179 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sema4bQ62179 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sema4bQ62179 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sema4bQ62179 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sema4bQ62179 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sema4bQ62179 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sema4bQ62179 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sema4bQ62179 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sema4bQ62179 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sema4bQ62179 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sema4bQ62179 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sema4bQ62179 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sema4bQ62179 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sema4bQ62179 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sema4bQ62179 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sema4bQ62179 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sema4bQ62179 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sema4bQ62179 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sema4bQ62179 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Sema4bQ62179 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sema4bQ62179 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sema4bQ62179 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sema4bQ62179 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sema4bQ62179 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sema4bQ62179 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sema4bQ62179 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sema4bQ62179 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sema4bQ62179 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sema4bQ62179 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Sema4bQ62179 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sema4bQ62179 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sema4bQ62179 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sema4bQ62179 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sema4bQ62179 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sema4bQ62179 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sema4bQ62179 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sema4bQ62179 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sema4bQ62179 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sema4bQ62179 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sema4bQ62179 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sema4bQ62179 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms