Protein–RNA interactions for Protein: Q62167

Ddx3x, ATP-dependent RNA helicase DDX3X, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 662 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx3xQ62167 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ddx3xQ62167 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ddx3xQ62167 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ddx3xQ62167 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ddx3xQ62167 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ddx3xQ62167 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ddx3xQ62167 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ddx3xQ62167 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ddx3xQ62167 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ddx3xQ62167 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Ddx3xQ62167 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ddx3xQ62167 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ddx3xQ62167 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Ddx3xQ62167 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ddx3xQ62167 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ddx3xQ62167 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ddx3xQ62167 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ddx3xQ62167 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ddx3xQ62167 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ddx3xQ62167 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ddx3xQ62167 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Ddx3xQ62167 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ddx3xQ62167 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ddx3xQ62167 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ddx3xQ62167 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ddx3xQ62167 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ddx3xQ62167 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ddx3xQ62167 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ddx3xQ62167 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ddx3xQ62167 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ddx3xQ62167 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ddx3xQ62167 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ddx3xQ62167 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ddx3xQ62167 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Ddx3xQ62167 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ddx3xQ62167 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ddx3xQ62167 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ddx3xQ62167 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ddx3xQ62167 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ddx3xQ62167 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ddx3xQ62167 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ddx3xQ62167 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Ddx3xQ62167 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ddx3xQ62167 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ddx3xQ62167 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ddx3xQ62167 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ddx3xQ62167 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ddx3xQ62167 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ddx3xQ62167 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ddx3xQ62167 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ddx3xQ62167 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ddx3xQ62167 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ddx3xQ62167 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ddx3xQ62167 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Ddx3xQ62167 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ddx3xQ62167 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ddx3xQ62167 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ddx3xQ62167 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ddx3xQ62167 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ddx3xQ62167 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ddx3xQ62167 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ddx3xQ62167 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ddx3xQ62167 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ddx3xQ62167 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ddx3xQ62167 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ddx3xQ62167 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ddx3xQ62167 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ddx3xQ62167 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ddx3xQ62167 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ddx3xQ62167 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ddx3xQ62167 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ddx3xQ62167 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ddx3xQ62167 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ddx3xQ62167 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ddx3xQ62167 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ddx3xQ62167 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ddx3xQ62167 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ddx3xQ62167 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ddx3xQ62167 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ddx3xQ62167 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ddx3xQ62167 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
Ddx3xQ62167 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ddx3xQ62167 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ddx3xQ62167 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ddx3xQ62167 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ddx3xQ62167 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Ddx3xQ62167 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Ddx3xQ62167 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ddx3xQ62167 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ddx3xQ62167 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ddx3xQ62167 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ddx3xQ62167 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ddx3xQ62167 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ddx3xQ62167 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ddx3xQ62167 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ddx3xQ62167 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ddx3xQ62167 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ddx3xQ62167 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ddx3xQ62167 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ddx3xQ62167 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms