Protein–RNA interactions for Protein: Q61789

Lama3, Laminin subunit alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 3,330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lama3Q61789 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Lama3Q61789 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lama3Q61789 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lama3Q61789 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lama3Q61789 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lama3Q61789 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lama3Q61789 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lama3Q61789 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lama3Q61789 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Lama3Q61789 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lama3Q61789 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lama3Q61789 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lama3Q61789 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lama3Q61789 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lama3Q61789 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lama3Q61789 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lama3Q61789 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lama3Q61789 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lama3Q61789 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lama3Q61789 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lama3Q61789 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lama3Q61789 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lama3Q61789 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lama3Q61789 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lama3Q61789 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lama3Q61789 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Lama3Q61789 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lama3Q61789 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lama3Q61789 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lama3Q61789 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lama3Q61789 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lama3Q61789 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lama3Q61789 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lama3Q61789 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lama3Q61789 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lama3Q61789 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lama3Q61789 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Lama3Q61789 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lama3Q61789 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lama3Q61789 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lama3Q61789 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Lama3Q61789 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lama3Q61789 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lama3Q61789 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lama3Q61789 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lama3Q61789 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lama3Q61789 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Lama3Q61789 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lama3Q61789 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lama3Q61789 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lama3Q61789 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lama3Q61789 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lama3Q61789 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lama3Q61789 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lama3Q61789 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lama3Q61789 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lama3Q61789 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lama3Q61789 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lama3Q61789 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lama3Q61789 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lama3Q61789 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lama3Q61789 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lama3Q61789 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lama3Q61789 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lama3Q61789 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Lama3Q61789 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lama3Q61789 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lama3Q61789 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lama3Q61789 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lama3Q61789 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lama3Q61789 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Lama3Q61789 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lama3Q61789 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lama3Q61789 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lama3Q61789 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Lama3Q61789 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lama3Q61789 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lama3Q61789 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lama3Q61789 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lama3Q61789 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lama3Q61789 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Lama3Q61789 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lama3Q61789 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lama3Q61789 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lama3Q61789 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lama3Q61789 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lama3Q61789 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lama3Q61789 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lama3Q61789 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lama3Q61789 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lama3Q61789 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lama3Q61789 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Lama3Q61789 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lama3Q61789 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lama3Q61789 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lama3Q61789 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lama3Q61789 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lama3Q61789 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Lama3Q61789 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lama3Q61789 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms