Protein–RNA interactions for Protein: Q61644

Pacsin1, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin1Q61644 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pacsin1Q61644 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pacsin1Q61644 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pacsin1Q61644 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Pacsin1Q61644 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pacsin1Q61644 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pacsin1Q61644 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pacsin1Q61644 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pacsin1Q61644 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pacsin1Q61644 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pacsin1Q61644 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pacsin1Q61644 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pacsin1Q61644 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pacsin1Q61644 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pacsin1Q61644 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pacsin1Q61644 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pacsin1Q61644 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pacsin1Q61644 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pacsin1Q61644 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pacsin1Q61644 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pacsin1Q61644 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Pacsin1Q61644 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pacsin1Q61644 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pacsin1Q61644 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pacsin1Q61644 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pacsin1Q61644 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pacsin1Q61644 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pacsin1Q61644 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pacsin1Q61644 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pacsin1Q61644 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pacsin1Q61644 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pacsin1Q61644 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pacsin1Q61644 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pacsin1Q61644 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pacsin1Q61644 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pacsin1Q61644 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pacsin1Q61644 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pacsin1Q61644 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pacsin1Q61644 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pacsin1Q61644 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pacsin1Q61644 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pacsin1Q61644 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pacsin1Q61644 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pacsin1Q61644 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pacsin1Q61644 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pacsin1Q61644 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pacsin1Q61644 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pacsin1Q61644 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pacsin1Q61644 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pacsin1Q61644 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pacsin1Q61644 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pacsin1Q61644 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pacsin1Q61644 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pacsin1Q61644 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pacsin1Q61644 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pacsin1Q61644 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pacsin1Q61644 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pacsin1Q61644 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Pacsin1Q61644 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pacsin1Q61644 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pacsin1Q61644 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pacsin1Q61644 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pacsin1Q61644 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pacsin1Q61644 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pacsin1Q61644 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pacsin1Q61644 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pacsin1Q61644 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pacsin1Q61644 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pacsin1Q61644 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pacsin1Q61644 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pacsin1Q61644 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Pacsin1Q61644 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pacsin1Q61644 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pacsin1Q61644 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pacsin1Q61644 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pacsin1Q61644 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pacsin1Q61644 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pacsin1Q61644 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pacsin1Q61644 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pacsin1Q61644 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pacsin1Q61644 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pacsin1Q61644 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pacsin1Q61644 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pacsin1Q61644 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pacsin1Q61644 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pacsin1Q61644 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pacsin1Q61644 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pacsin1Q61644 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pacsin1Q61644 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pacsin1Q61644 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pacsin1Q61644 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pacsin1Q61644 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pacsin1Q61644 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pacsin1Q61644 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pacsin1Q61644 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pacsin1Q61644 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pacsin1Q61644 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pacsin1Q61644 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pacsin1Q61644 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pacsin1Q61644 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms