Protein–RNA interactions for Protein: Q61474

Msi1, RNA-binding protein Musashi homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msi1Q61474 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Msi1Q61474 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Msi1Q61474 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Msi1Q61474 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Msi1Q61474 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Msi1Q61474 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Msi1Q61474 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Msi1Q61474 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Msi1Q61474 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Msi1Q61474 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Msi1Q61474 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Msi1Q61474 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Msi1Q61474 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Msi1Q61474 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Msi1Q61474 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Msi1Q61474 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Msi1Q61474 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Msi1Q61474 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Msi1Q61474 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Msi1Q61474 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Msi1Q61474 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Msi1Q61474 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Msi1Q61474 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Msi1Q61474 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Msi1Q61474 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Msi1Q61474 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Msi1Q61474 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Msi1Q61474 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Msi1Q61474 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Msi1Q61474 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Msi1Q61474 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Msi1Q61474 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Msi1Q61474 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Msi1Q61474 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Msi1Q61474 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Msi1Q61474 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Msi1Q61474 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Msi1Q61474 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Msi1Q61474 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Msi1Q61474 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Msi1Q61474 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Msi1Q61474 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Msi1Q61474 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Msi1Q61474 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Msi1Q61474 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Msi1Q61474 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Msi1Q61474 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Msi1Q61474 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Msi1Q61474 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Msi1Q61474 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Msi1Q61474 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Msi1Q61474 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Msi1Q61474 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Msi1Q61474 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Msi1Q61474 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Msi1Q61474 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Msi1Q61474 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Msi1Q61474 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Msi1Q61474 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Msi1Q61474 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Msi1Q61474 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Msi1Q61474 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Msi1Q61474 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Msi1Q61474 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Msi1Q61474 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Msi1Q61474 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Msi1Q61474 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Msi1Q61474 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Msi1Q61474 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Msi1Q61474 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Msi1Q61474 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Msi1Q61474 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Msi1Q61474 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Msi1Q61474 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Msi1Q61474 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Msi1Q61474 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Msi1Q61474 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Msi1Q61474 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Msi1Q61474 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Msi1Q61474 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Msi1Q61474 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Msi1Q61474 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Msi1Q61474 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Msi1Q61474 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Msi1Q61474 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Msi1Q61474 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Msi1Q61474 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Msi1Q61474 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Msi1Q61474 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Msi1Q61474 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Msi1Q61474 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Msi1Q61474 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Msi1Q61474 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Msi1Q61474 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Msi1Q61474 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Msi1Q61474 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Msi1Q61474 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Msi1Q61474 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Msi1Q61474 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Msi1Q61474 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms