Protein–RNA interactions for Protein: Q61220

Nell2, Protein kinase C-binding protein NELL2, mousemouse

Predictions only

Length 819 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nell2Q61220 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nell2Q61220 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nell2Q61220 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nell2Q61220 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nell2Q61220 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nell2Q61220 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nell2Q61220 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nell2Q61220 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nell2Q61220 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nell2Q61220 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nell2Q61220 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nell2Q61220 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nell2Q61220 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nell2Q61220 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nell2Q61220 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nell2Q61220 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nell2Q61220 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nell2Q61220 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nell2Q61220 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nell2Q61220 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nell2Q61220 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nell2Q61220 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nell2Q61220 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nell2Q61220 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nell2Q61220 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nell2Q61220 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nell2Q61220 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nell2Q61220 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nell2Q61220 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Nell2Q61220 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Nell2Q61220 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Nell2Q61220 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Nell2Q61220 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Nell2Q61220 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Nell2Q61220 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nell2Q61220 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nell2Q61220 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nell2Q61220 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nell2Q61220 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nell2Q61220 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nell2Q61220 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nell2Q61220 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nell2Q61220 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nell2Q61220 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nell2Q61220 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Nell2Q61220 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nell2Q61220 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nell2Q61220 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nell2Q61220 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nell2Q61220 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nell2Q61220 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nell2Q61220 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nell2Q61220 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nell2Q61220 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nell2Q61220 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nell2Q61220 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Nell2Q61220 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nell2Q61220 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nell2Q61220 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nell2Q61220 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nell2Q61220 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nell2Q61220 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nell2Q61220 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nell2Q61220 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nell2Q61220 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nell2Q61220 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nell2Q61220 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nell2Q61220 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nell2Q61220 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nell2Q61220 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nell2Q61220 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nell2Q61220 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nell2Q61220 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nell2Q61220 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Nell2Q61220 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nell2Q61220 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Nell2Q61220 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Nell2Q61220 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Nell2Q61220 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Nell2Q61220 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Nell2Q61220 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nell2Q61220 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nell2Q61220 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nell2Q61220 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nell2Q61220 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nell2Q61220 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Nell2Q61220 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nell2Q61220 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nell2Q61220 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nell2Q61220 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nell2Q61220 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nell2Q61220 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nell2Q61220 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nell2Q61220 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nell2Q61220 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nell2Q61220 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nell2Q61220 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nell2Q61220 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nell2Q61220 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nell2Q61220 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms